Računalniški heker Neo odkrije pretresljivo resnico: življenje, kakršnega pozna, je digitalna simulacija, ki jo vodi zlobna kiber-inteligenca. Pridruži se odporniškemu gibanju, ki se trudi uničiti iluzijo sveta, v katerem so ljudje sužnji.
V pristanišču Long Beach se nahaja 27 trupel, umirajoča priča pa uspe v grozi izgovoriti samo eno ime ... Kayser Soze. Carinski agent Daniel Kujan (Chazz Palminteri) mora najti strašnega morilca, odgovore pa morda pozna samo en človek - Verbal Kint (Kevin Spacey), majhen goljuf, ki je edini preživel pokol na Long Beachu. Verbal pove Kujanu neverjetno zgodbo. Vse se je začelo pred šestimi tedni, ko je nekdo sredi New Yorka oropal kamion, poln orožja. Zaradi morebitne indentifikacije policija pridrži peterico zakrnelih kriminalcev - Keatona (Gabriel Byrne), Mc McManusa (Stephen Baldwin), Hockneyja (Kevin Pollak), Fensterja (Benicio Del Toro) in Kinta. Med čakanjem v zaporniški celici pa eden od njih predlaga sodelovanje pri pri največjem podvigu njihovih karier. Keaton, nekdanji policist in najizkušenejši od peterice, ideji najprej nasprotuje, nato pa nanjo le pristane.
Uma Thurman je morilka, ki jo na njen poročni dan napadejo člani bande njenega šefa Billa (David Carradine). Uspeva preživeti napad, čeprav ostaja v komi. Pet let pozneje se zbudi s koščkom kovine na glavi in veliko željo po maščevanju v srcu.
Možje v črnem so od nekdaj varovali Zemljo pred sovražniki iz vesolja. Toda v najnovejši pustolovščini je izziv veliko večji: sovražnik se tokrat skriva med njimi samimi in znotraj tajne organizacije MIB.
Borci za svobodo Neo, Trinity in Morpheus se še naprej upirajo vojski digitalnih strojev z umetno inteligenco. Da bi preprečili iztrebljenje človeštva, morajo še bolje spoznati Matrico in ključno Neovo vlogo v igri za usodo sveta.
V zaključku trilogije "Matrica" se Neo (Keanu Reeves), Morpheus (Laurence Fishburne) in Trinity (Carrie-Anne Moss) borijo, da bi zadnje človeško mesto Sion ubranili pred ubijalskimi stroji, ki so si podjarmili in zasužnjili človeštvo.
Tommy Lee Jones in Will Smith se vračata v drugem delu akcijske komedije, kjer možje v črnem lovijo uporne Nezemljane. Človeštvo ogroža čedna zapeljivka, v resnici vesoljska pošast, ki hoče uničiti Zemljo. K in J morata spet v akcijo.