Gdy pewnego dnia nękany w pracy przez szefa młody mężczyzna budzi się w samym środku inwazji zombie, postanawia stworzyć listę rzeczy do zrobienia, zanim sam przeistoczy się w potwora.
Martin jako jedyny przeżył atak nazistowskich zombie, stracił jednak prawe ramię. Teraz budzi się w szpitalu po przeszczepie kończyny. Niespodziewanie okazuje się, że przyszyto mu rękę zmutowanego umarlaka, pułkownika Herzoga. Zbuntowana część ciała jest żądna krwi. Próbuje zabić innych ludzi oraz jego samego.
Akcja "Resident Evil: Zagłada" dzieje się w 3 lata po wydarzeniach z drugiej części filmu. Alice (Milla Jovovich), prowadzi opancerzony konwój z ludźmi, którzy nie są zarażeni wirusem T, na Alaskę. Korporacja Umbrella nie zapanowała nad wirusem, wynikiem czego, cały świat został skażony. Jedyna szansa to dotarcie do najmniej zaludnionych regionów kuli ziemskiej. Dr Isaacs (Iain Glen), jeden z twórców wirusa, za wszelką cenę próbuje przeszkodzić ocalałym w dotarciu do celu. Pomaga mu, skonstruowany przez niego dzięki wirusowi T, mutant najnowszej generacji.
Pracujący nad pierwszą książką, Clint, przyjmuje tymczasową posadę zastępcy nauczyciela angielskiego w podstawówce w miejscowości FT. Chicken, w stanie Illinois. W tym samym czasie do szkolnej stołówki zostaje sprowadzony zainfekowany drób, który zaczyna zamieniać uczniów w mięsożerne bestie. Nauczyciele zostają zmuszeni do zabarykadowania się w budynku, w oczekiwaniu na organy porządku publicznego. Kiedy dochodzą ich informacje, że epidemia rozprzestrzeniła się na całe miasto decydują się stanąć do walki z hordą oszalałych dzieciaków.
Młoda kobieta o imieniu Greta ma wypadek jadąc karetą. Wożnica ginie na miejscu, zaś ona - zachorowawszy na amnezję, trafia pod opiekę mieszkającej nieopodal pary. W ich pałacu dzieją się tajemnicze rzeczy - Gretę bada pracujący nad wskrzeszaniem zmarłych doktor Sturges, a jej opiekunowie zakochują się w niej. Niebawem dochodzi do serii niewytłumaczalnych zbrodni, podczas gdy Greta w dziwny sposób znika.
Samotna wędrówka po lesie kończy się tragicznie dla Beth Slocum. Umiera ona po ukąszeniu przez węża i pozostawia w żałobie swoich rodziców oraz chłopaka Zacha. Po pogrzebie Zach próbuje zaprzyjaźnić się z niedoszłymi teściami, jednak zostaje odrzucony. Próbując się dowiedzieć dlaczego, odkrywa, że jego dziewczyna zmartchwywstała. Rodzice Beth próbują utrzymać ten fakt w tajemnicy. Chłopak postanawia zrobić z dziewczyną zombie wszystko to, czego nie zdążyli spróbować za jej życia. Z czasem jednak dziewczyna zachowuje się coraz dziwniej.