Pepijas draugu un kaimiņu – Tomija un Annikas – vecāki aizceļo vasaras brīvdienās un atstāj bērnus Pepijas uzraudzībā uz veselām trim nedēļām. Tā jau nebūtu Pepija, ja šīs trīs nedēļas paietu rāmā mierā. Teju tūdaļ pa pudeļpastu pienāk ziņa no Pepijas tētuka, kuru tālu Klusajā okeānā sagūstījuši ļauni pirāti, kas pret viņu nejauki izturas un nedod tam ēst. Pepija to tā neatstās! Tā nu bērni dodas uz tālo salu gaisa balonā, kas ceļā kļūst par lidmašīnu. Viņi pārvar haizivju uzbrukumu, nokļūst uz vientuļas salas, sagrābj kuģi un kļūst par pirātiem. Tikmēr Pepijas tētis joprojām gaida, ka meita viņu izglābs. Vai viņai tas izdosies?
Vairākus gadus pēc tēva pazušanas, Megu un viņas brāli Čārlzu apciemo mistiskas būtnes, kuras paziņo, ka zina, kur tēvs atrodas. Lai viņu atrastu, Megai, viņas brālim un viņu draugam jādodas ceļojumā cauri laikam un telpai.