Η 10χρονη Τσιχίρο και οι γονείς της κατευθύνονται προς το νέο τους σπίτι στα προάστια, όταν ο πατέρας της αποφασίζει να κόψει δρόμο μέσα από ένα ερημικό δρομάκι. Η οικογένεια χάνεται σε ένα παράξενο τούνελ, που οδηγεί σε μια έρημη πόλη-φάντασμα και όπου, μυστηριωδώς, οι γονείς της Τσιχίρο θα μεταμορφωθούν σε γουρούνια. Η μικρή θα προσπαθήσει να λύσει τα μάγια, αντιμετωπίζοντας μάγισσες, πνεύματα και κάθε λογής θαύματα, με τη βοήθεια του Χάκου, ενός παράξενου παιδιού...

Σε μια αρχαία εποχή, σε μια γη που καλύπτεται από δάση, κατοικούν τα πνεύματα των θεών. Τότε, τα κτήνη και οι άνθρωποι συνυπήρχαν αρμονικά, όμως τα δάση με το πέρασμα του χρόνου απειλήθηκαν με συρρίκνωση. Αυτά που επιβίωσαν φυλάγονταν από τεράστια κτήνη που χρωστούσαν τη σύμπνοιά τους στο Θεό του Δάσους, γιατί τότε ήταν μια εποχή θεών και δαιμόνων.

1000 χρόνια μετά από έναν Παγκόσμιο Πόλεμο, ένα παραθαλάσσιο βασίλειο γνωστό ως Η Κοιλάδα των Ανέμων παραμένει ένας από τους λίγους κατοικήσιμους τόπους. Με αρχηγό τη γενναία πριγκίπισσα Ναυσικά, οι κάτοικοι της Κοιλάδας, πολεμούν συνεχώς τα παντοδύναμα έντονα Όχμου φυλακές της δηλητηριώδους ζούγκλας που κατακλύζει τη Γη. Η Ναυσικά και οι θαρραλέοι ακόλουθοί της πολεμούν για να ζωντανέψουν το σύνδεσμο της ανθρωπότητας με τη Γη.

Το 1988 μία ατομική βόμβα ισοπέδωσε το Τόκιο. 31 χρόνια μετά τον 3ο Παγκόσμιο Πόλεμο, το 2019, στο νέο-Τόκιο υπάρχει μεγάλη κοινωνική αναταραχή λόγω της ανεργίας και της κακής οικονομίας. Στο ανήσυχο αυτό σκηνικό, ο Τετσούο, μέλος μιας συμμορίας μοτοσικλετιστών, θα μπλεχτεί σε ένα απόρρητο κυβερνητικό σχέδιο, με το κωδικό όνομα Ακίρα. Ο Ακίρα θα ξυπνήσει τις κρυμμένες, υπερφυσικές ψυχικές δυνάμεις του Τετσούο, και θα πυροδοτήσει έναν αγώνα ελέγχου των τεράστιων αυτών δυνάμεων. Στο παιχνίδι αυτό θα συμμετάσχει ο Κανέντα, ο αρχηγός της συμμορίας που προσπαθεί να βοηθήσει το φίλο του, μια αντι-κυβερνητική οργάνωση, επιστήμονες τυφλωμένοι από την εξουσία, και φυσικά ο στρατός. Οι συνέπειες όμως, θα είναι καταστροφικές και εντελώς ανεξέλεγκτες...