Zatiaľ čo posledné epizódy seriálu sledovali výhradne vnútorné myšlienkové pochody hlavného hrdinu. End of Evangelion rozpráva príbeh o tom, čo sa dialo vonku, k čomu sa celý seriál schyľoval. Mladý Ikari Shinji naposledy usadne do mohutného stroja - Evangelionu, aby čelil poslednému kroku v evolúcií ľudstva. Prijme ho alebo sa postaví na odpor?

Jan Švankmajer sa vracia k dvom zdrojom svojej surrealistickej poetiky – ku Carollovej Alici v krajine zázrakov a k východiskám vlastnej tvorby. Inšpiroval sa knihou, predovšetkým však projektuje vlastné snové pocity, zážitky, predstavy a spomienky z detstva a zapája ich do Alenkinho príbehu. Využíva zvláštny odcudzovací efekt, akoby chcel diváka uistiť o neurčiteľnosti hraníc skutočného sveta a „reálneho“ neskutočna fantázie. Oslobodená imaginácia smeruje k oslobodeniu imaginácie diváka.

Neznámy muž kvôli svojej zvedavosti uviazne v byte, kde však platia úplne iné zákony. Pokus sa najesť dopadne katastrofálne, pretože sa lyžička premení v sitko, vajíčko má doslova ťažkotonážne vlastnosti a doska jedálenského stola je niekedy priepustná. Podobne je to aj s posteľou. Taká nenápadná vzbura obyčajných vecí...