12-årige Otis arbejder som succesfuld tv-skuespiller i Hollywood. Når Otis ikke arbejder, bor han på et motel i udkanten af byen sammen med sin anmassende og voldelige ex-rodeo klovnefar. Honey Boy følger to tidsperioder, hvor man følger et omstridt far-søn forhold og forsøget på at reparere det over 10 år.

En ung pige fotograferer en snigmorder, der dræber 4 på en kirkegård. Han ønsker ingen vidner. Carter, en veteran på en bondegård, står alene mellem ham og pigen.