El 1920, al Lower East Side, el barri jueu de Nova York, Noodles fa alguns robatoris amb els seus companys Cocky, Patsy i Dominic. Arriba un cinquè col.lega, Max, el més decidit i que aviat serà el cap de la banda. Durant una baralla amb la banda rival, Noodles venja l'assassinat de Cocky matant el cap de la banda i és empresonat. El 1930, Noodles surt de la presó i l'acullen els seus amics, que han prosperat gràcies a la prohibició. Quan s'aboleix la llei seca, Max té nous projectes i per aconseguir diners planeja robar el Banc de l'Estat. Espantat per aquesta idea, Noodles denuncia els seus amics. La policia els mata i Noodles, trasbalsat, es refugia en un fumador d'opi. El 1968, Noodles, envellit, acudeix a una misteriosa convocatòria i retroba els llocs de la seva infantesa. Acaba descobrint que Max encara és viu i que, portat per la seva ambició, sempre ha enganyat a tothom.
Un jove sense il·lusions lluita contra el seu insomni, conseqüència potser del seu tedi per la seva vida gris i rutinària. En un viatge amb avió coneix Tyler Durden, un carismàtic venedor de sabó que sosté una filosofia molt particular: el perfeccionisme és cosa de gent feble; en canvi, l'autodestrucció és l'única cosa que fa que realment la vida valgui la pena. Tots dos decideixen llavors formar un club secret de lluita on descarregar les seves frustracions i la seva ira que tindrà un èxit aclaparador.
Skynet ho segueix intentant, i ara és enviat un terminator evolucionat per tal de liquidar el jove John Connor, i la seva mare Sarah.
Uns delinqüents professionals que no es coneixen entre ells i que es mantenen a l'anonimat darrere de noms de colors (senyor Rosa, senyor Blanc, senyor Taronja...) han preparat minuciosament el robatori a una joieria. En el moment de l'atracament apareix inesperadament la policia i es produeix una massacre. Tot fa sospitar que hi ha un traïdor infiltrat. Reunits a porta tancada dins d'un vell magatzem abandonat, els supervivents s'enfrontaran entre ells decidits a descobrir qui els ha conduït a aquesta situació límit.
La pel·lícula consta de nou trames paral·leles que tenen lloc a la Vall de San Fernando, a Los Angeles: un nen prodigi, el presentador d'un concurs de televisió, un exnen prodigi, un moribund, el seu fill perdut, la dona i el infermer del moribund. Són històries aparentment independents, però que guarden entre si una relació estranya. Magnolia és el retrat de la vida americana vist a través d'una sèrie de vinyetes còmiques i commovedores.
Les últimes dotze hores de Jesús de Natzaret des del moment en què prega amb els seus deixebles al Mont de les Oliveres. Primer pateix la traïció de Judes Iscariot i és conduït a Jerusalem per ser jutjat pel Sanedrí. Els sacerdots, que busquen la seva condemna a mort, el presenten davant Pilat, el governador romà. Pilat escolta les acusacions en contra de Jesús i s'adona aviat que es tracta d'un conflicte polític. Així i tot, no pot evitar que Jesús rebi les tortures més cruels i infamants. Finalment, quan la multitud embogida li exigeix la crucifixió, se'n rentarà les mans.
John Constantine és un detectiu que, literalment, ha estat a l'infern i n'ha tornat. John va néixer amb un do que no desitjava: reconèixer entre la gent els àngels i els dimonis que viuen a la Terra sota un aspecte humà. Aquestes visions el turmentaven i va decidir suïcidar-se, però va ressuscitar en contra de la seva voluntat. Ara, havent vist l'infern, John ha de guanyar-se la salvació enviant els esbirros de Satanàs cap a les profunditats i també haurà d'ajudar una altra policia, Angela Dodson, a resoldre el misteriós suïcidi de la seva germana bessona.
Johnny, Carmen, Dizzy i Ace són quatre joves amics que finalitzen l'institut i fan plans per al futur. Hi domina l'espai com el lloc més desitjable per aprendre un ofici i treballar. La Terra es troba en guerra amb una raça d'insectes alienígenes gegants, i els quatre amics estudiaran disciplines per destruir-los. Però cadascú anirà a una unitat diferent, segons les capacitats. Johnny es veu separat de la seva xicota, Carmen, ja que ell ha d'anar a infanteria. El dia que Johnny decideix marxar de l'exèrcit, els insectes arrasen la ciutat natal. És la guerra.
Thomas "Neo" Anderson va prendre una costosa decisió quan va decidir fer la pregunta que Morfeu i Trinity havien formulat abans que ell. Cercar i acceptar la veritat. Alliberar la seva ment de Matrix. Ara, Neo adquireix un major domini dels seus extraordinaris poders mentre Sió cau assetjada per l'Exèrcit de les Màquines. Només una qüestió d'hores separa a l'últim enclavament humà a la Terra de 250.000 Sentinelles programats per destruir a la humanitat. Però els ciutadans de Sió, animats per la convicció de Morfeu que l'Elegit farà realitat la Profecia de l'Oracle i posarà fi a la guerra amb les Màquines, posen totes les seves esperances i expectatives en Neo, que es troba bloquejat per visions inquietants mentre cerca quines mesures prendre.
Després de passar el pitjor dia de la seva vida, el descontent reporter de televisió Bruce Nolan aconsegueix un poder diví, ja que recrimina a Déu que no té ni idea de com està portant "l'assumpte". Davant aquest desafiament, Déu decideix donar-li tots els seus poders per veure si és capaç de fer-ho millor que Ell.
Robert Langdon, un especialista nord-americà en simbologia de molt de renom és a París fent una conferència. El conservador del Louvre, Jacques Saunière, l'ha citat però no es presenta a la trobada. A mitja nit, la policia va a buscar Langdon a l'hotel ja que Saunière ha aparegut assassinat i ell n'és el principal sospitós. Sophie Neveu, una criptògrafa de la policia que resulta ser la néta de la víctima, ajuda Langdon a escapar i tots dos descobriran tot un seguit de secrets amagats en l'obra de Leonardo Da Vinci. Les pistes els conduiran fins a una societat secreta mil·lenària, l'objectiu de la qual ha estat ocultar el Sant Graal.
Queden vint hores per a la irrupció de les màquines a Sió, el darrer bastió dels humans lliures. Mentre el cos de Neo roman en coma, la seva consciència es troba a terra de ningú, en un lloc entre el món humà i el de les màquines.
Un guerrer cibernètic d'un futur post-apocalíptic, viatja cap enrere en el temps per a protegir un jove de 19 anys i la seva futura esposa d'un robot assassí més avançat, a més d'assegurar-se de que sobrevisquin a un atac nuclear...