Mitsumura is een laag geklasseerde samoerai. Zijn taak is het voorproeven van de maaltijden van de daimyo. Zo raakt hij vergiftigd en verliest hij voor altijd zijn zicht.

Als Zatôichi, een rondreizende masseur en groot samoerai, een door criminelen gerund dorpje binnentrekt, weerhoudt het feit dat hij blind is hem er niet van het aan de stok te krijgen met de lokale bende.

In de Edo-periode accepteert een naamloze ronin een opdracht om naar een bergpas te gaan en te wachten. In de buurt van de pas stopt hij bij een herberg waar een verzameling personages zich verzamelt, waaronder een bende die erop uit is shogunaat goud te stelen dat binnenkort over de pas zal komen. Wanneer de opdracht van de Ronin duidelijk wordt, krijgt hij de opdracht om de bewoners van de herberg te vermoorden, inclusief een vrouw die hij heeft gered van een gewelddadige echtgenoot. Hij is terughoudend om onschuldige mensen te vermoorden; Dan komt hij erachter dat de goudzending een valstrik is en dat hij deel uitmaakt van een dubbel spel.

Kyoto, 1865, het einde van het Edo-tijdperk. De jonge samoerai Kano Sozaburo wordt aangenomen als lid van de Shinsengumi, een boeddhistische zwaardvechterclan die de strikte waarden van het feodale Japan wil handhaven. De betoverend mooie, Kano blijkt een uitmuntend zwaardvechter, die de hoofden van de in een geïsoleerde mannengemeenschap levende samoerai op hol brengt.

Hanzo is een wetsdienaar met een hele merkwaardige methodiek: seksuele overreding. Wanneer hij weigert een ambtseed af te leggen waarin politieke corruptie gedoogd wordt, krijgt hij zijn superieuren op zijn dak. Samen met twee voormalige criminelen en zijn onuitputbare libido vecht hij zich terug.

De ontdekking van het lijk van een jong meisje, gestorven door een illegale abortus, brengt Hanzo op het spoor van een perverse en demonische samenzwering. De top van het Shogunaat lijkt er bij betrokken te zijn, wat drastische gevolgen voor de natie kan hebben.

Wanneer er een geest opduikt bij de wateren rond de schatkamer van het Shogunaat, gaat Hanzo op onderzoek uit en ontdekt dat het een dekmantel is voor het smokkelen van goud. Wederom hangt er een waas van corruptie en samenzweringen om heen.

Dwalende zwaardvechter Kanbei paradeert door de stad met een bord met de tekst 'Op zoek naar gevechten, mijn leven goedkoop verkopen.' Op een dag ontvangt hij een verzoek van de ster van de kabuki van zijn dochter, Nakamura Tsurukichi. Omdat hij het echter niet kan verdragen een gezicht te zien dat doet denken aan zijn eerste liefde, verdwijnt hij zodra de taak is voltooid. Maar later keert Tsurukichi terug om Kanbei opnieuw om hulp te vragen...