El 2029 el món és un corrent continu d'informació i els humans es connecten a la xarxa de totes les maneres imaginables. Una parella de policies cíborg de la Secció 9 malden per desemmascarar un misteriós hacker, el Titellaire.

Un cop més, Hinata és assassinat davant els ulls de Takemichiha per la banda Manjikai de Tòquio, ara militaritzada.

La Kokone és una jove estudiant que, a més d'ajudar al seu pare vidu amb les feines de casa, ha d'esforçar-se per mantenir-se desperta cada dia a classe. En el món dels seus somnis es converteix en la jove princesa Ancien del regne màgic de Corònia. La línia que separa els somnis de la realitat començarà a difuminar-se quan el seu pare és detingut per la policia i uns homes misteriosos venen a segrestar-la. La Kokone iniciarà una aventura on descobrirà el passat de la seva família.

Takemichi viatja 10 anys enrere en el temps per canviar un cas clau que pot salvar Hinata, que va ser assassinat per la banda Manjikai de Tòquio davant de Takemichi.