モンゴルの草原に住む遊牧民一家の長女ナンサ（ナンサル・バットチュルーン）は、ある日子犬と出会い「ツォーホル」と名づけてかわいがる。しかし父親に飼うことを反対されてしまう。

物語や神話を研究するナラトロジー（物語論）の専門家アリシアは、講演で訪れたトルコのイスタンブールで、美しいガラスの小瓶を手に入れる。ふたを開けると、巨大な魔人ジンが中から現れ、自由にしてくれたお礼に三つの願いをかなえようと彼女に申し出る。しかし物語の専門家であるアリシアは、魔人の誘いに乗らなかった。

幕末の京都。便りの途絶えた父を捜しに来た男装姿の少女・千鶴は、夜の路地裏で浪人に襲われ逃げる途中、人間とは思えぬ異形の者に遭遇。異形の者を一撃で倒し、窮地の千鶴を救ったのは新選組だった。新選組と一緒に父を捜すことになった千鶴は、やがて新選組の闇、自身の出自にまつわる秘密を知ることになり……。

人間や動物が誕生する以前、不老不死の者達が天国で互いに敵対し戦っていた。勝利者達は自らを神と呼び、敗者となったタイタンはタルタロス山の下に封印された。この戦争中、計り知れない力を持つエピロスの弓が地球上でなくなった。紀元前1228年、イラクリオンの人間の王ハイペリオン(ミッキー・ローク)は家族を失った恨みを晴らすため、タイタンを解き放ち神を倒す目的でこの弓を探す。 ゼウスに選ばれた人間テセウスは、人類を滅ぼす武器を手に入れようとギリシャ中で暴れまわる冷酷なハイペリオン王との戦いを指揮する。