En flyvende tallerken lander, og ud træder et væsen, som fortæller jorden at hvis jordens beboere ikke lærer at leve i fred, så vil planeten blive erklæret en trussel mod universet, og destrueret.
En aften, da Roy Neary er på arbejde, bliver han vidne til ankomsten af væsener fra en anden verden. Han ser en UFO, men denne gang er han ikke den eneste. Hele verden bliver vidne til den egentlige ankomst, og mens myndighederne forsøger at holde sandheden skjult, er der - som Roy - en række mennesker rundt omkring på kloden, der er blevet specielt udvalgt til at følge de fremmede til en anden verden. Dette er grundhistorien i Steven Spielbergs banebrydende science fiction film fra 1977, der på én gang markerede genrens genfødsel og intelligente fornyelse.
Hele jorden er i alvorlig fare for udslettelse, da en masse fjendtligsindede rumvæsener begynder at pulverisere den ene storby efter den anden. Jagerpiloten Steven (Will Smith), Computerteknikeren David (Jeff Goldblum) og selve den amerikanske præsident (Bill Pullman) er bare nogle af de personer, der forsøger at rede menneskeheden fra destruktion.
Da en terrorbombe sprænger en bygning i Dallas, Texas i luften, bliver FBI-agenterne Fox Mulder og Dana Scully draget ind i en farlig sammensværgelse, der langt overstiger det, de før har oplevet. Med tvivlsom assistance fra en paranoid læge, sætter Mulder og Scully deres karrierer og deres liv på spil for at opspore en dødbringende virus, som måske stammer fra det ydre rum - og kan udslette alt liv på Jorden. Deres jagt på sandheden sætter dem op mod det gådefulde Syndikat, magtfulde mænd, der ikke viger tilbage for noget for at bevare deres hemmelighed, og agenterne føres fra en hule i Texas til FBI's egne kontorer og endelig til et hemmeligt anlæg på Antarktis, som gemmer på den største hemmelighed af dem alle.
Et reality-tv-team tager ud for at filme pilotafsnittet til deres nye program: Extremely Haunted Hoarders. De ankommer til Rockford i Ohio, hvor de møder Murph Evans, en notorisk samler med bras fra gulv til loft i de fire hjemsøgte huse, han ejer.