Durant la Segona Guerra Mundial, Rasputin va enviar des de l'infern a la Terra un dimoni anomenat Hellboy per acabar amb la humanitat. Els aliats van aconseguir reconduir els seus poders extraordinaris cap al bé i convertir-lo en un heroi que lluita contra les forces del mal.
Quan un virus es filtra d'una instal·lació d'alt secret, convertint tots els investigadors residents en zombis voraços i els seus animals de laboratori en gossos mutats de l'infern, el govern envia un grup de treball militar d'elit per contenir el brot.
Alice es desperta enmig de la devastada ciutat de Raccoon. Els morts vivents, contra els quals ella i el seu esquadró d'elit van lluitar tant, ho envaïxen tot. Alice lluitarà sense treva amb l'ajuda d'una nova força que posseeix després d'haver estat objecte d'un experiment d'alteració biològica. Alice rescata un grup de supervivents i junts faran front als morts vivents i també a una nova amenaça que plana damunt de tota la humanitat: una terrible criatura anomenada Nèmesi.