未来的シミュレーターの中で孤独に暮らす少女・凛（リン）は、 毎日永遠の命が続く無限の美しいバーチャルリアリティーの世界で目を覚まし、タブレットを使ってシミュレーターを操作し、自分のための新世界を空想し創造しつづけている。しかし、現実世界の凛は実は昏睡状態にいて、その体は小さな宇宙船内のＶＲシミュレーター内に・・・

夏休みを楽しむため、ポケモン広場にやってきたサトシ達一行。ピカチュウは、サトシから皆の面倒を見る様に言われる。 しかし、おなかをすかせたトゲピーが泣き出してしまう。どうにか寝かしつけたものの、おしゃべりをし騒いでいたカラカラ達のせいで起きてしまう。 ゼニガメやフシギダネと言い争いになったのを止めようとするピカチュウであったが、逆に巻き込まれ、ドタバタ劇に発展していく。

ある日、一休みして昼寝をしていたサトシとピカチュウ一行。しかし、昼寝から目覚めたトゲピーが坂から転がっていってしまう。それに気づいたピカチュウ達はあわてて追いかけるもトゲピーはニャースと共に穴の中に落ちていってしまう。心配しているところにコダックの押し出しによってピカチュウ達も穴の中に落ちてしまう。出た先は、ポケモン達だけが暮らすポケモン谷であった。

ここは海辺にある大きなお屋敷。ピカチュウたちはそこで「かくれんぼ」をして遊ぶことに。ピカチュウがオニに決まって、さあ、みんな上手に隠れることができたかな?! そのころヨーギラスは、ひとりぼっちがおもしろくなくて、大きな石をけったんだ。それが芝刈り機に命中して動き出しちゃった！ピカチュウたちを追いかけて大暴走！ 迷路に追い込んでも海に落としても芝刈り機はへっちゃら。みんなで丸太を運んで道を作って小屋に入れるつもりだけれど、ドジなコダックが転んでしまって、さあ大変！ハラハラドキドキのファンタジー。