Com o Tenente Jim Gordon e o Procurador-geral Harvey Dent, Batman decide destruir o crime organizado. Mas surge um criminoso em ascensão, Joker, que leva Gotham à anarquia e força o Dark Knight a ficar perto de passar de herói a vigilante.

A U.S.S. Enterprise está em manobras de treino e o Almirante James T. Kirk parece resignado com o facto de esta poder ser a sua última missão. Contudo, um incidente na Estação Espacial Regula One revela o regresso de Khan, um velho inimigo de Kirk, disposto a destruir a Terra para se vingar.

Khan foi derrotado mas Spock morreu e McCoy parece ter herdado a sua essência viva. Kirk tenta ajudá-los, desafiando a Federação e partindo numa viagem não-autorizada, com o objectivo de devolver a vida ao seu melhor amigo. Mas os Klingons estão à espreita...