Any 2029. En una enorme ciutat asiàtica, una dona robot policia cíborg investiga les sinistres activitats d'un misteriós hacker, un supercriminal que està envaint les autopistes de la informació. Ghost in the shell 2.0 és una remasterització/remake del clàssic original dirigit per Mamoru Oshii el 1995, basat al seu torn en el manga de Masamune Shinow.
Un treballador de línies elèctriques te un avistament d'un ovni. Des d'aleshores s'obsessiona amb el tema i fins i tot li arriben visions d'una muntanya a la que ha d'anar-hi.
Han passat tres anys i Batô segueix a la Secció 9. El record de la comandant Kusanagi no l'abandona. Ara ha d'investigar el cas d'una robot femenina destinada al plaer, que ha assassinat el seu propietari.
Enemics per instint, amics per necessitat, un humà i un alienígena amb aspecte de rèptil lliuren en un planeta hostil una dura batalla, part de la salvatge guerra que enfronta la terra amb el planeta Dracon, habitat per éssers monstruosos. Aquesta guerra assoleix una dimensió que pot posar en perill la supervivència dels dos planetes i pot conduir a l'extermini total, però només forçats a confiar l'un a l'altre aconseguiran sobreviure.
L'any 2022 el capità John Robbins és conduït a Absolom, una illa selvàtica on els presos més conflictius són abandonats fins a la mort. Robbins s'enfronta a una situació límit: la lluita contra una societat salvatge i primitiva, els presos més terribles i els dimonis del seu passat. Per a Robbins només hi ha una sortida: escapar a tota costa d'Absolom.