La nau de la confederació espacial USS Reliant rep senyals de vida del planeta desèrtic Ceti Alfa V, i decideix investigar-les. Entre la tripulació de la Reliant que baixa al planeta es troba l'oficial Chekov, antic membre de l'Enterprise. Però l'únic que troba l'expedició és una balisa encesa entre les restes de la nau Botany Bay.
Estem en el segle XXIII i un misteriós poder alienígena amenaça la Terra, evaporant els oceans i destruint l'atmosfera. En un frenètic intent per salvar la humanitat, Kirk i la seva tripulació viatgen en el temps i tornen al San Francisco de 1986, trobant-se amb un món de punks, pizza i autobusos de canvi exacte que resulten ser tan alienígenes com tot el que s'han trobat als llocs més recòndits de la galàxia. Una missió emocionant i repleta d'acció per a la nau espacial Enterprise.
Després d'anys de guerra, la Federació i l'imperi Klingon es disposen per a una conferència de pau. Però el panorama d'una negociació intergalàctica amb implacables enemics, preocupa a l'Almirall Kirk. “Són animals!”, adverteix. Quan una nau Klingon és atacada i responsabilitzen a l'Enterprise, els gossos de la guerra tornen a ser alliberats: ambdós mons es preparen per al que pot ser la seva trobada definitiva.
La victòria de l'almirall Kirk sobre Khan i la creació del planeta Gènesi són triomfs inútils. Spock ha mort i McCoy, inexplicablement, s'ha tornat boig. Una visita de Sarek, el pare de Spock, revela quelcom esglaiador: McCoy està albergant en el seu cos l'essència vital de Spock. Kirk tracta d'ajudar als seus amics, segresta l'Enterprise i desafia la quarantena imposada per la Flota Estel·lar en Gènesi. Però els Klingon també descobreixen l'existència de Gènesi i van a la trobada de Kirk en una cita que podria ser mortal.
El capità Jean-Luc Picard i la tripulació de l'Enterprise-D es troben en contradicció amb el científic renegat Soren ... que està destruint sistemes solars sencers. Només un home pot ajudar en Picard... i és mort des de fa setanta-vuit anys.
Ja fa dos anys des que la Enterprise acabés la seva missió. La majoria de la tripulació resta a la Enterprise millorant-la sota la supervisió del nou capità en funcions William Decker. En James T. Kirk ha estat ascendit a almirall, el Dr. McCoi ara és un metge civil, l'Spock resta a Vulcà practicant el Kolinahr. Un misteriós núvol d'energia és detectat en espai Kinglon i sembla dirigir-se a la Terra, destruint pel camí tres naus Klingon classe K't'inga i l'estació Epsilon 9. Un cop més, la nau estel·lar Enterprise salparà a la recerca del desconegut, aquest cop per a intentar salvar la Terra.
Uns platets voladors procedents de Mart es troben sobre totes les capitals del món, i tota la humanitat conté la respiració esperant veure quines són les seves intencions. Entre ells està el president dels Estats Units, l'assessor científic del qual li assegura que seran absolutament pacífics. No obstant això els seus assessors militars li aconsellen que anihili als marcians abans que sigui massa tard.
En una societat futura, algunes persones són triades en néixer per convertir-se en soldats, i entrenats amb tanta precisió que es transformen en màquines de matar éssers humans. Un d'aquests soldats més destacats mesura les seves forces amb una nova casta de soldats, i després de la confrontació se'l considera mort. El seu cos és abandonat en un planeta colonial semidespoblat, on coneixerà altres aspectes de la vida. Però haurà de lluitar novament contra aquesta casta de soldats... aquesta vegada per defensar la seva nova llar.
El planeta Krull és atacat per un monstre i tot un exèrcit d'alienígenes assassins. Per fer-los front, dues nacions enemigues decideixen ajuntar les seves forces unint en matrimoni el príncep Colwyn i la princesa Lyssa, però el dia de la cerimònia el palau és assaltat, la princesa segrestada i Colwyn ferit. El primer que ha de fer el príncep és trobar una espasa voladora amb poders extraordinaris que us servirà per trobar la princesa i lliurar al planeta de l'amenaça de la bèstia.
La nau Enterprise es dirigeix al planeta Nimbus III per negociar l'alliberament d'uns ambaixadors segrestats. Allí descobriran que el cap de la banda és un parent de Spock obsessionat per trobar el planeta que és considerat la font de la vida.
Han passat set anys, i en Brennick, juntament amb la resta dels rebels han estat capturats i enviats a una presó encara més sofisticada, a l'espai exterior.