怪盗キッドから警視庁に犯行予告が届く。彼が狙うのは鈴木財閥の会長宅から見つかったロマノフ王朝の秘宝“インペリアル・イースター・エッグ”の新たな1個だった。鈴木会長から保護依頼を受けた探偵・毛利小五郎に同行し、コナンと蘭も会長宅のある大阪へと向かう。厳重な警備が敷かれる中、キッドは警察の裏をかく大胆な手口でエッグを盗み出すことに成功するが、ハンググライダーで逃走中に何者かに撃たれ、墜落してしまう。

湾岸戦争で出会った勇敢で個性的な兵士4人、リーダーのハンニバルらからなる特殊部隊《Aチーム》は、イラクの戦場で再びチームを結成。イラク戦争末期、ゲリラが米ドル紙幣の偽造原版や偽札を持って逃げるのを阻止する任務に就くが、奪回した偽造原版を何者かに盗まれ、チームに指令を下した上官が殺されるなどの事態が連続し、《Aチーム》はすべての責任を負わされそうになる。裁判の前に逃げた4人は彼らをはめた黒幕を追う。