Mentre juga en una platja rocallosa, Sasuke, un nen de cinc anys, troba una peixeta de colors anomenada Ponyo amb el cap encallat en un pot de melmelada. Sasuke la rescata i li diu: No et preocupis, jo et protegiré i et cuidaré. No obstant això, el pare de la Ponyo, un bruixot que viu a les profunditats de l'oceà, l'obliga a tornar. Vull ser humana! exclama la Ponyo i, decidida a convertir-se en una nena i tornar amb Sasuke, escapa. Però no li serà gens fàcil aconseguir reunir-se amb ell.

Han passat tres anys i Batô segueix a la Secció 9. El record de la comandant Kusanagi no l'abandona. Ara ha d'investigar el cas d'una robot femenina destinada al plaer, que ha assassinat el seu propietari.

Aclamada pel·lícula d'animació que narra les aventures d'uns petits dinosaures en el viatge per assolir la Gran Vall, l'únic lloc de la terra que encara no ha estat aconseguit per una plaga devastadora.

En Shin chan és a casa jugant quan una misteriosa llum cau del cel i xoca de ple contra ell, concedint-li estranys superpoders. Al mateix temps, una llum fosca arriba a un noi no gaire afortunat. Dos membres del Comitè Internacional de Poders Psíquics de Saitama expliquen als Nohara que amb la llum blanca el seu fill s'ha convertit en l'escollit de què parla una antiga profecia i que s'haurà d'enfrontar al supermalvat que la llum fosca ha creat. Mentre una misteriosa organització recluta el supermalvat, en Shin chan haurà d’aprendre a controlar els seus superpoders per protegir la pau de la Terra. Se’n sortirà?