Het eerste afspraakje van Meg en Paul eindigt in mineur wanneer Paul een oude zwerver aanrijdt. De man heeft heel veel pijn aan zijn hand, waaraan een soort van groen vergif kleeft. Hij beweert dat het spul uit de hemel is komen vallen. Meg, Paul en Brian Flagg, die getuige was van het ongeval, brengen de man meteen naar het ziekenhuis. Het ding aan de hand van de man wordt alsmaar groter en vreet zijn hele lichaam op. Die nacht nog worden er zes mensen door dezelfde blubber vermoord.
Wanneer de ouderwetse monsters Frank, Drac en Wolf door een rechtbank van oudsten als 'leuk' worden beschouwd, worden ze veroordeeld om een gezin in een buitenwijk bang te maken, anders lopen ze het risico om voor altijd feestartiesten te worden.
Wanneer New York City wordt bedreigd, is de hulp van de Turtles meer dan welkom. Maar Raphael, Donatello en Michelangelo weten niet meer wat zij moeten doen. Het is nu aan Leonardo en zen-meester Splinter om hen weer op het juiste pad te krijgen en de Ninja Turtles in ere te herstellen.
Een groep van drie you tubers die zichzelf experts op het gebied van bovennatuurlijke wezens noemen, besluit voor eens en voor altijd publieke erkenning te verwerven. Hiervoor bedenken ze een plan om een bij iedereen bekend wezen gevangen te nemen. Het is de geest van een lichtharige vrouw die op onbekende wijze is gestorven en die door de toiletten van scholen door het hele land spookt: de blondine in de badkamer.
Julie James weet, na de gebeurtenissen in het eerste deel, eindelijk haar leventje weer op te pakken. Haar kamergenote wint een reis voor vier personen naar een tropisch eiland, en om de stress tegen te gaan besluit Julie mee te gaan. Op het eiland blijkt er echter iemand te zijn die nog steeds weet wat ze vorig jaar allemaal uitgespookt heeft.
Mad Dr. Frankenstein rekruteert een boze dwerg, een Neanderthaler en anderen om hem te helpen hersenen in het lichaam van een bruut te plaatsen.
De mondiale temperaturen dalen nadat een aardbeving midden in de Atlantische Oceaan heeft plaatsgevonden. Terwijl de wereld begint te bevriezen en steden in verval raken, moeten wetenschappers een manier bedenken om de temperatuur vóór de volgende ijstijd te verhogen.