De documentaire volgt Bill Maher tijdens een reis rond de wereld, waarin hij op zoek is naar meer informatie over God en religie. Maher's onorthodoxe manier van interviewen en zijn persoonlijkheid garanderen een zeer ongewone zoektocht naar spiritualiteit.
Een documentaire over 's werelds snelst groeiende religie: De Kerk van het Vliegende Spaghettimonster. R'Amen.
Houda al-Habash, een conservatieve moslimprediker, stichtte een Koranschool voor meisjes in Damascus, Syrië toen ze nog maar 17 jaar oud was. Elke zomer dompelen haar vrouwelijke studenten zich onder in een rigoureuze studie van de islam, naast hun seculiere opleiding. Er is een verrassende culturele verschuiving aan de gang: vrouwen claimen ruimte in de moskee, een plek die van oudsher wordt gedomineerd door mannen. Houda daagt de traditie uit en benadrukt dat onderwijs voor vrouwen een vorm van aanbidding is. Met behulp van de Koranische leer moedigt ze haar studenten aan om hoger onderwijs, banen en het openbare leven te volgen, terwijl ze zich blijft inzetten voor een interpretatie van de islam die prioriteit geeft aan de rol van vrouwen als echtgenotes en moeders. In een wereld die zelden wordt gezien, vertelt The Light In Her Eyes het verhaal van een leider die de vrouwen van haar gemeenschap uitdaagt om volgens de islam te leven, zonder hun dromen op te geven.