Este filme é uma continuação e conclusão do anime de 2003 de Fullmetal Alchemist. A história passa-se dois anos depois de Edward ter ido para o nosso mundo. Este vive em Munique juntamente com uma pessoa muito parecida com o seu irmão Alphonse, que lhe irá ajudar a voltar para o seu mundo.
A aventura começa com o aparecimento de Mewtwo, um Pokémon bio-genético criado a partir do DNA de Mew, o mais raro e poderoso Pokémon. Determinado em provar a sua superioridade, Mewtwo desafia Ash, Pikachu e todos os outros para um combate nunca antes visto. Mewtwo contra Mew. Super-Clones contra Pokémon. Este é o derradeiro combate... onde o futuro da humanidade está em jogo!
Dos mesmos criadores de A Marcha dos Pingüins. Ambientado no vasto reino da neve no topo do mundo o filme acompanha a impressionante luta pela sobrevivência de Nanu, o filhote de urso polar e Seela, o pequeno leão-marinho.
No meio da floresta do Amazonas, numa lagoa perdida, um grupo de cientistas descobre na passagem do meio aquático para o terrestre o "elo que faltava" na evolução: um estranho ser anfíbio.
Não caiam sobre o Feitiço do Unown! Uma catástrofe de cristal cai sobre a pacifica cidadede Greenville e Ash, Pikachu e os seus amigos tentam descobrir como reparar os danos à cidade. Mas a Mãe de Ashé raptada pelo poderoso Entei, um Pokémon que todos julgavam existir apenas em lendas.Ash é forçado a partir para o desconhecido para salvá-la, mas nem ele sabe o que fazer quando descobre o verdadeiro segredo por detrás destes estranhos acontecimentos: o mundo de sonho de uma jovem rapariga estáa povoar a nossa realidade com pesadelos através do poder do mais poderoso Pokémon jamais visto - o Unown!
O publicitário Jeffrey (Rupert Graves), o diretor Ian (Rufus Sewell) e o operador de câmera Will (Devon Sawa) formam uma equipe unida, que são famosos por sempre conseguirem rodar as cenas necessárias para um comercial de TV. Até que um de seus clientes pede uma cena considerada impossível de ser feita: a de esquiadores descendo uma montanha com uma avalanche atrás deles. Decididos a cumprir a tarefa o trio parte para os Alpes austríacos, juntamente com três esquiadores profissionais. Porém, o que eles não sabem é que no local para onde estão indo está escondido Slobodan Pavle (Klaus Löwitsch), um perigoso criminoso sérvio, que está junto a uma gangue de terroristas.