미나토 가문이 살고 있는 '아야카시'에 괴수가 나타나지 않은 지 1년의 시간이 흘렀다. 미나토 가문도 평화로운 나날을 보내고 있었지만, 자신의 '꿈'을 향해 착실하게 걸어가는 이사미와 아사히에 비해 카츠미는 미래의 진로를 결정하지 못하고 있었다. 그래서 카츠미는 고등학교 시절 친구이자 게임 크리에이터를 꿈꾸던 토이를 오랜만에 만나기로 한다. 하지만 토이는 이미 취업한 게임 회사를 그만두고 집에 틀어박혀 지내고 있었다. 카츠미는 토이의 모습에 충격을 받는다. 그런 토이의 닫힌 마음에 사악한 접근을 시도한 것은 트레기어라는 정체불명의 존재였다. 그리고 트레기아는 이번에는 카츠미의 마음에도 접근한다. 카츠미를 지구에서 멀리 떨어진, 괴수들이 사는 외계로 날려 보낸 것이다. 그리고 지구에서는 출현한 괴수 스네이크 다크니스를 이사미가 변신한 울트라맨불과 다른 세계에서 날아온 아사쿠라 리쿠-울트라맨지드가 맞이한다. 과연 카츠미는 가족의 품으로 돌아갈 수 있을까?　그리고 무시무시한 트레기아의 정체와 그 목적은? 지금, 인연의 힘이 기적을 불러일으키는 ......!

새로운 작품에 대한 열정이 넘치던 영화감독은 거리에서 우연히 발굴한 매력적인 여인 앤 대로우와 함께 영화 촬영을 위해 해골섬을 찾아 떠난다. 그리고 수억만 년 전의 고대 정글이 고스란히 존재하는 해골섬에서 그들은 전설로만 들어왔던 거대한 킹콩과 맞닥뜨린다. 해골섬의 원주민들에게 붙잡혀 제물로 바쳐진 앤의 아름다움에 매료된 킹콩. 갑자기 섬에 존재하는 잔인한 공룡이 나타나 그녀를 공격하고 킹콩은 공룡과 혈전을 벌이며 그녀를 지켜낸다. 그러나 탐욕스러운 욕망에 사로잡힌 감독은 킹콩이 앤에게 마음을 빼앗긴 틈을 타 킹콩을 뉴욕으로 생포해온다. 뉴욕 도심에서 사람들의 구경거리로 전락한 킹콩의 분노는 극에 달하고 야수의 본능을 드러내며 뉴욕 도심을 휩쓸기 시작하는데...

전 세계를 초토화시켰던 전쟁 이후, 지구 종말의 위기가 다시 찾아온다. 더 강렬하게 진화한 적들의 공격이 인류의 재앙을 불러오고 최정예 파일럿과 업그레이드 된 거대 로봇 예거 군단은 사상 최대의 반격을 시작한다. 하지만 아무도 예상치 못했던 또 다른 적의 등장으로 인류는 전대미문의 위기에 봉착하게 되는데...

울트라맨 제로, 글렌파이어, 밀러나이트 점보트, 울트라맨 제로로 결성된 '울티메이트 포스 제로'와 한때 함께 모험을 펼쳤던 에메랄나 공주와의 재회. 와의 재회는 수수께끼의 거대한 인공 천구의 맹공격으로 인해 깨지고 만다. 천구는 에메랄나 공주의 우주 요트와 점보트를 내부로 포획한 후 다른 우주로 전송하고 소멸해 버린다. 한편, 천구가 전송된 다른 우주에서는 ZAP의 레이와 휴가를 위해 휴가를 떠나려던 휴가 선장 휴우가 행성 브람의 눈앞에 갑자기 나타난 수수께끼의 천구를 조사하러 간다. 조사하러 갔다. 천구의 내부로 잠입한 두 사람이 그곳에서 본 것은 역대 울트라맨들을 괴롭혔던 메카로봇들의 모습이었다. 이 인공 천체는 수수께끼의 "비트스타"의 명령에 따라 모든 우주의 배틀 로봇을 흡수하여 최강의 메카 로봇 군단을 만들어 '유기 생명체 말살'을 꾀하는 강철의 천구였다. 구인 것이다. 그 천구 내부로 시공을 초월해 달려가는 울트라맨 제로들. 하지만 그곳에 점보트를 꼭 닮은 최강 메카로봇 '정킬러'가 등장한다! 로봇 군단과 함께 제로 일행의 앞을 가로막는데....

NASA는 거대 유인원 아브라함을 모델로 힘과 규모에서 아브라함에 버금가는 기계 유인원을 설계한다. 하지만 첫 번째 실험 결과가 좋지 않게 나오자 미 국방성에서는 난폭한 기계 유인원을 막기 위해 감옥에 갇힌 아브라함을 석방하도록 지시한다. 한편 볼로드레츠카 외국 정보부는 기계 유인원에 핵탄두를 부착해 기계 유인원의 시스템을 교란시켜 미국 시카고를 날려버릴 계략을 꾸민다. 이를 막기 위해 NASA의 관계자들은 아브라함과 소통하는 방법을 통해 기계 유인원을 막으려 하는데....