H Makoto Konno είναι μια όχι και τόσο καλή μαθήτρια, η οποία περνάει τον ελεύθερο της χρόνο παρέα με δύο φίλους της, τον Chiaki Mamiya και τον Tsuda Kousuke. Ξαφνικά, μια μέρα ανακαλύπτει πως έχει την ικανότητα να πηγαίνει πίσω στον χρόνο. Όπως είναι φυσικό, εκμεταλλεύεται την ικανότητα της για προσωπικό της όφελος, όπως για παράδειγμα να μην αργεί ποτέ στο σχολείο, ή να ξέρει τις ερωτήσεις των διαγωνισμάτων στο σχολείο ώστε να γράφει τέλεια. Γενικά , χρησιμοποιεί την ικανότητα της ακόμα και για ασήμαντους λόγους , κάτι που όμως θα δημιουργήσει σύντομα προβλήματα στην ίδια και στους φίλους της.

Ο Ας πρέπει να εμποδίσει έναν ασυνείδητο συλλέκτη πόκεμον να συλλάβει τρία μυθικά πουλιά που διατηρούν την ισορροπία της φύσης πάνω στη Γη, ελέγχοντας τη φωτιά, τον κεραυνό και τον πάγο.

Τρία παιδιά πίνουν ένα μαγικό ελιξίριο που τα μεταμορφώνει σε πλάσματα της θάλασσας. Έχουν μόνο σαράντα οκτώ ώρες να βρουν το αντίδοτο, το οποίο για κακή τους τύχη πέφτει στα χέρια του Τζο, ενός ψαριού με δικτατορικές τάσεις, που το χρησιμοποιεί στα σχέδιά του για να γίνει κυρίαρχος της θάλασσας.

Σε μια εναλλακτική ιστορία της συνέπειας του δεύτερου παγκόσμιου πολέμου, η Ιαπωνία έχει χωριστεί στη μέση, με το νότο – Honshu και τα άλλα νησιά – να έχουν συμμαχήσει με τις Ηνωμένες Πολιτείες και το βόρειο νησί Hokkaido που προσαρτάται από μια αινιγματική Ένωση. Ήταν στο Hokkaido που χτίστηκε ένας μυστήριος πύργος, ένα σκέλος από μέταλλο που φθάνει επάνω από την ατμόσφαιρα, ορατό από τη βόρεια άκρη Honshu.Το 1996, τρεις έφηβοι, ο Hiroki, ο Takuya και η Sayuri, κάνουν μια συμφωνία – θα χτίσουν ένα πειραματικό αεροσκάφος, σχεδόν αόρατο στην επιτήρηση, θα διασχίσουν το Hokkaido και θα ξεκλειδώσουν τα μυστικά του πύργου. Το όνειρό τους δεν πραγματοποιήθηκε ποτέ, επειδή η Sayuri εστάλη στο Τόκιο για ιατρική περίθαλψη αφότου περιήλθε σε κώμα.

Στην προσπαθεια του να ξεφυγει απο εναν κυνηγο ποκεμον το celebi χρησιμοποιη την ικανοτητα του να ταξιδευει στο χρονο. Μαζι του περνει και ενα αγορι τον Σαμι που προσπαθουσε να το βοηθησει. Ο Ας με την υπολοιπη παρεα μαζι με τον Σαμι και το celebi θα αντιμετοπησουν αυτον τον εχθρο ο οποιος διαθετη μια μπαλα γνωστη και ως darkball που μετατρεπει τα καλα ποκεμον σε πολυ ισχυρα κακα ποκεμον. Θα καταφερουν ο Ας, ο Σαμι και το celebi να σωσουν τον κοσμο