Седам месеци након што је вирус опустошио британска острва, америчка војска објављује да је рат против вируса добијен и да реконструкција земље може да почне. У првом таласу избеглица које се враћају, породица се поново окупља - али један од њих несвесно носи страшну тајну. Вирус још увек није истребљен, а овог пута је смртоноснији но икад.

Како би спасили своје животе, група тинејџера мораће да се суочи са својим највећим страховима.

Прошло је годину дана откако је др Норман Спенсер (Харисон Форд) преварио своју лепу жену Клер (Мишел Фајфер). Пошто Клер не зна ништа о томе, а и афера је окончана, Норманов брак и живот делују савршено и то у толикој мери да, кад му Клер саопшти да чује тајанствене гласове и да види дух једне младе жене у њиховој кући, он њен све већи страх приписује халуцинацијама. Ипак, како се Клер све више приближава истини, постаје све јасније да се ова утвара не може заташкати и да се вратила по др Нормана и његову лепу жену.

Филм сведочи о застрашујућем путовању троје филмаџија кроз шуму Блек Хилса, откривајући ужасне догађаје који су се збивали пред њиховим камерама. Филмаџије још увек нису пронађене. Годину дана након нестанка, пронађен је њихов снимљени материјал. „Пројект: Вештица из Блера“ је њихова оставштина.

На сваких 1000 година Сотона долази на Земљу како би покушао да изазове крај света, тако што ће оплодити посебно одабрану, жену. Године 1979. таква се жена рађа у Њујорку. Ватикан је свестан шта се догодило. Док једни заговарају да се девојка за сваки случај ликвидира, дотле Папа сматра да се Сотона може победити само вером у Бога. Двадесет година касније бивши полицајац Јерихо Кејн, који се одао алкохолу након погибије своје породице, заједно са партнером Чикагом обавља рутински посао чувања њујоршког банкара. Када банкар постане мета неуспешног атентата, Кејн хвата починитеља, за којег се испостави да је у питању полудели бивши свештеник Томас Аквинус. Кејн започиње истрагу а траг га води до 20-годишње Кристине Јорк, девојке коју у последње време муче мрачне визије. Када сама постане мета атентатора, Кејн ће је спасити, али у тело банкара се увукао Сотона лично. Заједно са хордама својих следбеника он ће покушати да силује девојку у последњем сату 1999. године.