Dipimpin oleh Woody, mainan Andy hidup bahagia di kamarnya hingga ulang tahun Andy membawa Buzz Lightyear ke dunia hiburan. Karena takut kehilangan tempatnya di hati Andy, Woody berkomplot melawan Buzz. Namun, ketika keadaan memisahkan Buzz dan Woody dari pemiliknya, keduanya akhirnya belajar untuk mengesampingkan perbedaan mereka.

Saat Lembah Perdamaian terancam, Po si panda pemalas menemukan takdirnya sebagai "yang terpilih" dan berlatih untuk menjadi pahlawan kung fu.

Burger Beard adalah bajak laut yang sedang mencari halaman akhir dari buku ajaib yang membuat segala rencana jahat yang ia tulis di dalamnya menjadi nyata, yang terjadi kepada formula rahasia Krabby Patty. Saat seluruh kota Bikini Bottom dalam bahaya, SpongeBob, Patrick, Tuan Krabs, Squidward, Sandy, dan Plankton perlu melakukan misi yang membawa mereka ke permukaan. Untuk membawa kembali resepnya dan menyelamatkan kota, mereka harus mengambil bukunya dan mengubah mereka menjadi pahlawan super.

Dalam sekuel jenaka ini, ketiga sahabat, Alvin, Simon, dan Theodore melakukan perjalanan lintas negara demi menghentikan wali mereka, Dave, melamar pacarnya.