Després de viure uns anys a la presó, en Jake Blues és alliberat per bon comportament. Surt del centre penitenciari vestit de la mateixa manera que va entrar: vestit i barret negres i ulleres fosques. A la porta l'espera el seu germà Elwood vestit de manera idèntica. Ara, l'única llar que van conèixer està en perill. L'orfenat de Santa Elena necessita una gran quantitat de diners, i ells intervindran.
Conta la història de quatre divertits animals del zoo de Central Park a Nova York (Alex el lleó, Marty la zebra, Glòria l'hipopòtam i Melman la girafa). Porten tota la seva vida tancats en captivitat sense poder experimentar la llibertat i s'han proposat idear un pla per sortir-ne junts. Un dia, una sèrie de casualitats els porten a aconseguir allò que tant anhelaven i fugen d'aquell lloc. Acaben en plena naturalesa, concretament a la idíl·lica illa de Madagascar. Allà descobriran, amb apassionants aventures, que la vida salvatge és molt diferent del que ells pensaven i que viure en llibertat no és tan fàcil com imaginaven.
En Billy i la Kate treballen a Nova York a l'empresa d'alta tecnologia del magnat Daniel Clamp. Ella fa de guia als visitants a qui ensenya les meravelles amb què treballa el seu cap i Billy té la feina condicionada per un executiu tafaner. A l'empresa Clamp també hi treballa el doctor Catheter a qui el laboratori se li converteix en una zona de joc dels Gremlins. La reaparició de Gizmo, el seu amic Mogwai, els recorda com tractar aquests animalets i tots tres col·laboren per impedir que provoquin una catàstrofe a les instal·lacions de l'empresa.
La June té una capacitat de creació desbordant. Li agrada concebre parcs d’atraccions imaginaris, màgics... Els pensa, els dibuixa... però, un parc d’atraccions, inventat amb la imaginació, pot esdevenir real?
Uns platets voladors procedents de Mart es troben sobre totes les capitals del món, i tota la humanitat conté la respiració esperant veure quines són les seves intencions. Entre ells està el president dels Estats Units, l'assessor científic del qual li assegura que seran absolutament pacífics. No obstant això els seus assessors militars li aconsellen que anihili als marcians abans que sigui massa tard.