大都市アドベンチャー・シティに魔法の隕石が落ちる。その隕石はパウ・パトロールたちに新しいマイティパワーを与え、最強の子犬“マイティ・パウ・パトロール”に変身する。しかし、宿敵ライバール市長が恐ろしく切れ者のマッドサイエンティスト、ヴィクトリアと手を組み、このマイティパワーを奪おうと画策する。このピンチを、リーダーのケントとマイティ・パウ・パトロールたちは、マイティパワーでパウっと解決できるのか？

博物館の学芸員で、言語学者であるマイロ・サッチは、アトランティスに関する新しい学説を発表するが、館長に無視される。そんな時、彼の前に、謎の女性、ヘルガ・シンクレアが現れる。彼女に連れられ、プレストン・ウィットモア氏のマンションに行ったマイロは、ウィットモア氏に熱意を認められ、アトランティスの探検隊に入れてもらう。

閑古鳥が鳴く、宇宙のアミューズメント・パーク。集客のため、バッグス・バニーら地球の人気アニメキャラたち、“ルーニー・テューンズ”を誘拐して見せ物にしようと計画する。バッグスたちがパークから派遣された怪物“ナードラックス”に、バスケの試合の勝敗で彼らに同行するかどうか決めると持ちかけると、それは承諾され、バッグスはバスケ界を引退したばかりの大物ジョーダンに助っ人役を頼む。そして運命の大試合を迎える。