Het verhaal begint wanneer een middelbare scholier die muziekvideo's maakt een leraar ontmoet die de muziek heeft opgegeven. Asaya Kanata, maker van amateurmuziekvideo's, ziet leraar en muzikant Yū Orie op straat lopen en besluit een videoclip van haar muziek te maken.
Anna is een verlegen meisje dat vanwege haar gezondheid naar haar oom en tante in een dorp aan de kust wordt gestuurd. Ze stelt zich niet open op tegenover anderen en blijft introvert. Anna ontmoet vervolgens een vreemd meisje genaamd Marnie. Ze worden vrienden, maar geen van de dorpsbewoners weet iets van Marnies bestaan af.
In de verre technologische toekomst heeft de beschaving zijn ultieme op het internet gebaseerde vorm bereikt. Een "infectie" in het verleden zorgde ervoor dat de geautomatiseerde systemen ontregeld werden, wat resulteerde in een gelaagde stadsstructuur die zich oneindig in alle richtingen repliceert.
Er is een arrestatiebevel uitgevaardigd, maar deze keer is dat niet tegen Lupin. De autoriteiten zitten achter inspecteur Zenigata aan, omdat ze vermoeden dat Pops al die tijd onder één hoedje heeft gespeeld met de meesterdief. In een poging om Zenigata's onschuld te garanderen, wordt Lupin uitgedaagd om het merkwaardige Tijdkristal te stelen. Terwijl Lupin en zijn bende achter de beroemde diamant aan gaan, wordt hij geconfronteerd met het onverwachte verraad van zijn meest vertrouwde partner.
De Kamen Rider Club ontdekt dat de Dai-Zangyack-vloot op weg is naar de aarde, geleid door Captain Marvelous als hun Grote Keizer. Met veel nieuw leven ingeblazen Super Sentai-schurken onder zijn bevel, is Captain Marvelous van plan om de Grote Kracht van de Kamen Riders te verkrijgen, waarvan wordt gezegd dat het 'Ultieme Schat in het Universum' is. Ondertussen wordt Tsukasa Kadoya opnieuw de Grote Leider van Dai-Shocker en rekruteert hij voormalige vijanden van de Kamen Riders om de Super Sentai-teams uit te schakelen.
Dit grillige verhaal vertelt het verhaal van kleine wezens genaamd Zipper Yokai, wiens taak het is om elke open rits die ze tegenkomen te sluiten