Andy berangkat ke Cowboy Camp, meninggalkan mainannya sendiri. Keadaan menjadi semakin rumit ketika seorang kolektor mainan yang obsesif bernama Al McWhiggen, pemilik Al's Toy Barn menculik Woody. Mainan-mainan Andy melakukan misi penyelamatan yang berani, Buzz Lightyear bertemu dengan lawannya dan Woody harus memutuskan di mana ia dan hatinya benar-benar berada.

Bagi Letnan Pete 'Maverick' Mitchell dan temannya serta co-pilot Nick 'Goose' Bradshaw, diterima di sekolah pelatihan elit untuk pilot pesawat tempur adalah mimpi yang menjadi kenyataan. Tapi sebuah tragedi, serta setan pribadi, akan mengancam impian Pete untuk menjadi pilot ace.