Dora, seorang gadis yang telah menghabiskan sebagian besar hidupnya menjelajahi hutan bersama orang tuanya, sekarang harus menavigasi petualangannya yang paling berbahaya: sekolah menengah. Selalu sebagai penjelajah, Dora dengan cepat menemukan dirinya memimpin Boots (sahabatnya, seekor monyet), Diego, dan sekelompok remaja muda dalam petualangan untuk menyelamatkan orangtuanya dan memecahkan misteri yang mustahil di balik peradaban Inca yang hilang.

Didasarkan dari kisah nyata, bercerita tentang seorang penjelajah dari Inggris, Kolonel Percival Fawcett yang hilang saat mencari kota misterius di Amazon pada tahun 1920-an.