Swackhammer, eigenaar van een groot amusementspark, is op zoek naar een nieuwe attractie. Hij besluit dat de Looney Toons karakters perfect zijn, en ontvoert ze. Hij gaat echter akkoord met Bugs Buggy's voorstel om voor hun vrijheid te spelen in een potje basketbal. De Toons krijgen hiervan de hulp van de gepensioneerde Michael Jordan.
De vier pinguïns, Skipper, Rico, Kowalski en Private bundelen hun krachten met de chique spionagedienst de 'North Wind' die onder leiding staat van agent Classified. Samen moeten ze het opnemen tegen de kwaadaardige Dr. Octavius Brine die de wereld wil veroveren.
Adam, een adolescent en eenzame dromer, die over bovennatuurlijke bevoegdheden beschikt, besluit om te vertrekken en naar zijn vader te zoeken, die sinds jaren in geheimzinnige omstandigheden is verdwenen.
De vier puppy's van Lady en Tramp wonen bij een net gezinnetje in een mooi rustig en groot huis. Rakker, één van de puppy's, voelt zich echter helemaal niet thuis in deze omgeving. Hij heeft genoeg van alle regeltjes die in huis gelden, aangezien deze in zijn ogen alle vrijheid ontnemen. Als hij op een dag voor straf buiten aan een ketting wordt gelegd is de maat voor hem vol, zeker wanneer hij een aantal zwerfhonden op straat lol ziet maken. Hij ziet kans om zichzelf te ontketenen en wil zich bij de groep zwerfhonden voegen. Deze willen hem enkel toelaten wanneer hij een aantal gevaarlijke tests doorstaat. Ondertussen zijn Lady en Tramp wanhopig naar hem op zoek.
Big Bird wordt door een sociaal werker weggestuurd naar Ocean View in Illinois, om daar enige tijd door te brengen met zijn soortgenoten, de Dodo's. Big Bird voelt zich echter helemaal niet thuis bij de Dodo's, waardoor hij erg verdrietig is en heimwee heeft. Big Bird besluit daarom om zijn spullen te pakken en te voet terug te keren naar zijn vriendjes van Sesamstraat.
Molly Mahoney is de manager van Mr. Magorium's Wonder Emporium, de vreemdste en meteen de grootste speelgoedhandel op aarde. Als de 243-jarige Mr. Magorium de winkel aan haar overlaat, gebeuren er vreemde dingen.
Na de dood van zijn vrouw is Jake Barnes samen met zijn zoon Sean en dochter Jessie naar Alaska verhuisd. Ook al was hij vroeger burgerpiloot, in het onherbergzame gebied gaat hij als luchtkoerier aan de slag. Wanneer hij op een dag een dringende bestelling moet leveren en zich door een hevige storm moet worstelen, raakt zijn vliegtuigje vermist in de bergen. Jessie en Sean vinden dat de overheid te weinig energie stopt in de zoektocht naar hun vader. Ze besluiten zelf naar hem op zoek te gaan en ondernemen een gevaarlijk avontuur waarbij ze de hulp krijgen van een ijsbeer die ze uit de handen van een pelsjager gered hebben.
God vraagt nieuwbakken Congreslid Evan Baxter om een Ark te bouwen om de wereld te redden van een tweede grote overstroming, net zoals Noach dat ooit kreeg opgedragen. Evan's familie denkt aanvankelijk dat hij mentaal ingestort is, maar na verloop van tijd blijken er wel degelijk Bijbelse motieven in het spel te zijn.
John is een beveiligingsagent die zwaargewond raakt in een explosie beraamd door een kwaadaardig meesterbrein. Hij wordt naar een laboratorium gebracht waar zijn beschadigde ledematen worden vervangen door gerobotiseerde, waarna hij zijn nieuwe krachten gebruikt om samen met nicht Penny en trouwe hond Brein te achterhalen wie er achter de explosie zat.