Hoog in de wolken creëren levende wolken, dag in, dag uit, baby-dieren en mensen, die ze vervolgens door hun ooievaars laten bezorgen. Gus, een eenzame grijze wolk, heeft echter de ondankbare taak om jonge roofdieren en andere minder aantrekkelijke creaties zoals krokodillen en stekelvarkens te maken. Zijn ooievaar Peck is er ook niet blij mee, daar hij vaak door deze dieren gebeten of geprikt wordt. Pecks volgende bestelling is een babyhaai en hij ziet er behoorlijk tegenop deze te moeten afleveren. Hij vertrekt dan ook zonder de haai. Gus voelt zich afgewezen en laat uit woede een onweersbui los, gevolgd door een regenbui. Peck keert echter spoedig weer terug, met een helm en schouderbeschermers die een andere wolk voor hem gemaakt heeft.
Balto is een zwervershond die niet bepaald geliefd is. Hij steelt z'n eten en zwerft over de straten. Hij heeft een oogje op Jenna, een vrouwtjeshond waarvan het bazinnetje ernstig ziek is geworden door een ziekteverspreiding. Het medicijn moet vervoerd worden vanaf Nenana, een stad ver van Nome.
Na de dood van zijn vader gaat hij naar Alaska om in diens voetsporen te treden als goudzoeker. Het is niet makkelijk voor hem in de barre omstandigheden, maar hij vindt warmte bij een wolvenjong, dat van de indianen de naam White Fang heeft meegekregen.
Wanneer er plotseling een babypanda uit de dierentuin wordt gestolen, zijn stoere politiehond Max en politieman Frank gedwongen om samen te werken en undercover te gaan tijdens één van de meest exclusieve hondenshows van Las Vegas.
De kleine Patch voelt zich een beetje verloren tussen al die vlekken en verlangt er naar zich van de andere puppies te onderscheiden. Hij droomt ervan een 'Wonderhond' te worden, net als zijn favoriete televisiester, Superwoef.
Linus en Lucy's jongere broer Rerun wil een hond voor Kerstmis, en Snoopy's broer Spike kan het antwoord zijn.
Na hals over kop verliefd te worden op Gisele, neemt Elliot's weg naar het altaar een onverwachte wending wanneer Mr. Weenie gekidnapt wordt door een bende verwende huisdieren, vastberaden om hem terug naar zijn eigenaars te brengen. Boog, Elliot, McSquizzy, Buddy en de rest van de Woodland-inwoners zetten een grote reddingsactie op poten voor hun worstvormige vriend en bevinden zich al snel in het kamp van de vijand: de wereld van de huisdieren. Aangevoerd door een minipoedel genaamd Fifi is het leger huisdieren niet van plan Mr. Weenie zonder slag of stoot te laten gaan. Verslaat een minipoedel echt een Grizzly? Zal Elliot ooit met Giselle trouwen?
De twaalfjarige Owen ( Liam Aiken) heeft eindelijk zijn eigen hondje gekregen. Er is echter iets vreemds aan de hand met hondje Hubble (Broderick), want naast allerlei schattige trucjes kan hij ook praten! Hubbie blijkt een buitenaardse agent te zijn, afkomstig van de ster Sirius. Owen ontdekt dat Hubble en al zijn hondenvrienden vele jaren geleden naar de aarde zijn gekomen om de planeet te veroveren! Dat is niet helemaal gelukt wat de honden zijn uiteindelijk onze huisdieren geworden. Hubble maakt zich nu enorme zorgen want zijn grote baas is onderweg naar de aarde voor een inspectie. Owen en Hubble bedenken daarom een slim plan. . .
De familie Newton gaat op vakantie naar de Bahama's, maar de kleine Sara gaat bij haar oom logeren in de vakantie. Terwijl Sara en haar oom Freddy, aan het vissen zijn, vindt Beethoven een tiendollar-biljet uit 1920. Dit geld blijkt afkomstig te zijn van Rita en Moe (de Bonnie & Clyde van de jaren '20). Iemand uit het stadje komt er achter dat Beethoven dit biljet heeft gevonden, en ineens begint de hele stad vreemd te doen.
Aan het begin van de zomervakantie gaat Tammy, de beste vriendin en tevens buurmeisje van Andrea, verhuizen naar Californië. Andrea mag daar komen logeren maar moet dan een deel van de reiskosten zelf verdienen. Dat doet ze door zich aan te bieden als dierenoppas. Per vergissing laat haar broertje Noah de tuindeur openstaan waardoor alle dieren ontsnappen en een ravage aanrichten op een zomermarkt. Weg al het zuurverdiende geld. Toevallig is de nieuwe buurjongen een volleybalfanaat die meedoet aan strandvolleybal. De hoofdprijs is een reis naar Californië voor het hele team en dat lijkt mogelijk te worden wanneer men ontdekt dat Buddy zich uitstekend in die tak van sport kan weren.
In dit derde deel van de serie krijgt de Ubriacco-familie te maken met twee honden: Rocks, een bastaard van de straat, en de verwende poedel Daphne. James heeft net een nieuwe baan, en Mollie zit de hele dag thuis aangezien zij haar baan net kwijt is.
De Newtons gaan met de kampeerwagen op vakantie. Vader Richard is bijzonder opgetogen, maar de kinderen vinden zo'n lange rit maar niks, tot er plots een onverwachte lifter opduikt: Beethoven!!! Beethoven zorgt naar gewoonte weer voor een heleboel verrassingenen pret, maar wanneer twee stuntelige dieven het pad van de Newtons kruisen, is hij het die de familie beschermt en verdedigt.
De Newtons zijn aangenaam verrast als ze vaststellen dat Beethoven gehoorzaam is geworden. Wat ze echter niet weten is dat Beethoven gewoon van plaats heeft gewisseld met een andere hond, en zelf gezellig bij een steenrijke familie inwoont.
Het is bijna Kerstmis, maar voor de 12-jarige Emma O'Conner lijkt dat geen leuke tijd te worden. Ze heeft geen moeder meer en haar vader is werkloos, waardoor zij uit hun huis worden gezet. Papa ziet geen andere mogelijkheid dan zijn dochter naar tante Delores te sturen. Als Emma daar aankomt, blijkt zij helemaal niet welkom te zijn. Net als de honden in de stad trouwens. Burgemeester Nobel Doyle wil namelijk een wet tegen honden invoeren.
Terwijl ze aan het bekomen zijn van hun eerste spannende avontuur, ontdekt Josh dat zijn hond Buddy niet alleen een kei is in basketbal, maar ook nog een aardig potje American football kan spelen. Binnen de kortste keren is Buddy alweer de sensatie van de buurt.
Garfields 29-jarige winning streak in de jaarlijkse Fun Fest-talentenwedstrijd wordt bedreigd door een onstuimige nieuwkomer, Ramone, die over grote charme beschikt. Bezorgd dat hij zijn gave zal verliezen, gaat Garfield op zoek naar de mythische vijver van Freddy Frog, waar wordt gezegd dat iedereen die ervan drinkt zeker grappig zal zijn.