Film ini bercerita tentang perbedaan waktu antara Takoshi dan Emi. Waktu mereka berjalan berlawanan, dunia mereka berbeda. Emi dari masa depan Takoshi dan Takoshi dari masa depan Emi. Waktu mereka hanya akan bersinggungan selama satu bulan setiap 5 tahun sekali.

Pada tahun 298 dari era para dewa, gadis sekolah dasar Washio Sumi, Nogi Sonoko, dan Minowa Gin ditugaskan dengan misi penting. Mereka akan menjadi pahlawan dan melawan Vertex, musuh misterius yang menyerang Shinju-sama, pohon dewa yang melindungi Shikoku, satu-satunya wilayah di dunia yang masih layak huni. Apa yang tidak mereka ketahui, adalah bahwa pertarungan ini akan menelan biaya lebih dari yang pernah mereka bayangkan.

Kisah ketika Dilan di usia 12 tahun yang sempat ikut bapaknya bertugas dinas di Timor Timur (kini negara Timor Leste). Dilan menikmati tinggal di sana dan tinggal di sana selama 1,5 tahun dan kembali ke Bandung dan bersekolah di tempat lamanya. Pada tahun 1983, Dilan bertemu dengan Mei Lien, siswa baru Tionghoa asal Semarang di sekolahnya.