Suzume Iwato (suara Nanoka Hara) gadis berusia 17 tahun, tinggal di daerah Miyazaki, Kyushu, sebuah kota pantai yang tenang di Jepang. Dalam perjalanannya ke sekolah, ia bertemu seorang pemuda bernama Sōta Munakata (suara Hokuto Matsumura), yang sedang berkeliling mencari bangunan terbengkalai yang memiliki pintu. Suzume lalu mendapatkan penglihatan dan menemukan sebuah pintu tua yang berdiri tegak di antara reruntuhan. Pintu misterius tersebut membawanya ke dalam sebuah petualangan dan misi tak terduga untuk membantu pemuda tersebut mencegah bencana alam yang mengancam Jepang.
Wening, seorang ibu mengalami kejadian tragis ketika Nirmala, anaknya yang berusia 11 tahun, hilang dalam kecelakaan motor di sebuah jembatan. Kecelakaan itu juga merenggut nyawa Uti Yah, ibunda Wening. Wening merasa sangat berdosa karena membuat ibunya meninggal dan anaknya hanyut di sungai, tapi dia percaya Nirmala masih hidup. Tirta, seorang perempuan kreator podcast misteri, berminat memviralkan tragisnya kehidupan Wening, namun bantuannya malah membuat Tirta menyibak rahasia gelap masa lalu Wening yang mengakibatkan hilangnya Nirmala. Dengan segala upaya dan penuh harapan, Wening mencari Nirmala, termasuk meminta bantuan Tetsuya, peneliti dari Jepang. Wening juga meminta bantuan Mbah Gowa, seorang dukun misterius. Namun, di tengah pencarian, Wening selalu didatangi oleh hantu Uti Yah. Akankah Wening bersatu lagi dengan Nirmala?