Alex, Marty, Melman, Gloria, regele Julien, Maurice, pinguinii și maimuțele s-au întors și sunt încă naufragiați în Madagascar. În fața acestui obstacol New yorkezii au născocit un plan atât de nebunesc încât s-ar putea să meargă. Cu precizie militară, pinguinii au reparat un avion vechi prăbușit, oarecum
Philip conduce o linie telefonică de urgență împreună cu Catherine și doama Munchnik. Aceasta este partea ușoară a problemei însă, lucrurile se complică. Lui Philip îi place să ajute oamenii și este iubit de către Catherine.
Cât timp mama e plecată, un băiețel plictisit și o fetiță sunt vizitați de Cotoiul cu pălărioi, care face în casă un tărăboi cum nu s-a mai văzut.