Terwijl een computervirus gebaseerd op Pac-Man Japan binnendringt, valt een groep artsen Genm Corp aan en begint een golf van terreur met behulp van gestolen Proto Gashats. Ghost en Ex-Aid bevinden zich in het middelpunt van de strijd in een poging degenen die voor hen het belangrijkst zijn te beschermen. Maar ze zijn niet de enigen: Heisei Riders uit het verleden sluiten zich bij hen aan om Dr. Pac-Man tegen te houden!
Een mysterieuze man genaamd Es/Kamen Rider Eden is opgedoken en pleegt gelijktijdig terreurdaden over de hele wereld, waarbij duizenden gelovigen zijn geloof volgen. Terwijl de mensen één voor één vallen en de wereld in chaos stort, staat Aruto Hiden op om hem tegen te houden. Isamu Fuwa, Yaiba Yuia, Gai Amatsu, plus Jin en Horobi van MetsubouJinrai.net transformeren ook in Kamen Riders en vechten tegen de vijand terwijl ze worstelen om de waarheid te zoeken.
Enkele jaren na de gebeurtenissen uit de eerste film is het Jaegerprogramma ten prooi gevallen aan corruptie en zijn de massavernietigingswapens in verkeerde handen gevallen. De machine Gipsy Avenger is hiervan een voorbeeld.
Ryo Murasame, een vliegtuigpiloot, en zijn zus lopen door de Amazone als een UFO hen neerschiet. Ze overleven en worden gevangengenomen door het Badan-rijk. Zijn zus wordt gedood, terwijl Ryo de Combat Roid wordt die bekend staat als ZX. Zijn geheugen wordt gewist door het Badan-rijk en hij fungeert als hun kwaadaardige agent. Dit duurt niet lang; Ryo krijgt zijn geheugen terug en ontsnapt uit Badan. Een jaar later begint Ryo zijn aanval op Badan terwijl ze hun doemdagwapen afmaken: het Space Break-systeem.
De Spelwereld lanceert een aanval op de echte wereld en voor de ogen van de Gamer Riders en de Kyurangers wordt een 'Arena of Death' gematerialiseerd, die het podium zal zijn dat het lot van de wereld zal bepalen. Gevangen in een dimensie vol onvoorspelbare puzzels die onze wereld verbinden met de gamewereld, moet een generatie helden vechten om deze dodelijke strijd te beëindigen. Wanneer deze helden weer tot leven komen, zullen alle regels worden overtreden, en wanneer de wereld op het punt staat te vallen, zal de verbeelding een nieuwe groep helden voortbrengen die nog nooit eerder is gezien!