廃墟となっているかつての哭倉村に足を踏み入れた鬼太郎と目玉おやじ。 目玉おやじは、70年前にこの村で起こった出来事を想い出していた。 あの男との出会い、そして二人が立ち向かった運命について… 昭和31年―日本の政財界を裏で牛耳る龍賀一族によって支配されていた哭倉村。血液銀行に勤める水木は当主・時貞の死の弔いを建前に野心と密命を背負い、また鬼太郎の父は妻を探すために、それぞれ村へと足を踏み入れた。龍賀一族では、時貞の跡継ぎについて醜い争いが始まっていた。そんな中、村の神社にて一族の一人が惨殺される。それは恐ろしい怪奇の連鎖の本当の始まりだった。鬼太郎の父たちの出会いと運命、圧倒的絶望の中で二人が見たものはー

1941年のルーマニア。ボーマン大尉率いるドイツ国防軍の小隊は、山道を守る任務に就くため、広大なキープ（城塞）を拠点にしようとする。先祖代々キープの番人を務める老人は退去を忠告するが、ボーマンはその忠告を聞き流して部隊を入れる。その夜、壁に埋め込まれていた十字架を抜き取った見張りの兵士が謎の死を遂げてしまう。事態の解明を依頼された考古学者クザ教授の前に、キープに封印されていた魔物が姿を現す。

以前は優秀な兵士で、現在はラスベガスの裏社会で用心棒をしているニック。ある日、誰かにひどい暴行を受け重傷を負った元恋人から犯人捜しと復讐を依頼される。瞬く間にそれを成し遂げたニックだが、犯人の背後には権力を駆使しラスベガスを支配する凶悪マフィアが控えていた。

ハロウィンが近づくころから、ナーバスになっていたローリー（スカウト・テイラー＝コンプトン）。そんなときにルーミス医師（マルコム・マクダウェル）の本が発売され、自分が殺人鬼マイケル・マイヤーズ（タイラー・メイン）の妹だと知ってしまう。やけになったローリーは家を飛び出すが、マイケルが再び現れ……。