Wanneer boosaardige wezens, versterkt door de wetenschappelijke arrogantie van de mens, de mensheid en haar voortbestaan bedreigen slaat Moeder Natuur terug met haar eigen ultieme wapen, Godzilla, een verwoestende natuurkracht, die het in een heftige strijd zal opnemen tegen deze creaturen. Te midden van alle geweld en chaos volgen we drie leden van een gezin. Joe Brody is een wetenschapper in Japan.
In Hongkong ontmoet de voortvluchtige Dan Hardesty vluchtig Joan Ames en hij voelt zich tijdens een gezamenlijke cocktail aangetrokken tot haar. Wanneer hij de bar verlaat, wordt Dan gearresteerd door Steve Burke.