Forskeren Will Rodman arbejder på en banebrydende kur mod Alzheimers sygdom, en farlig sygdom, hans far også lider under. Hans forsøgsdyr er chimpansen Caesar, der reagerer på behandlingen ved at blive ekstremt intelligent. Caesar ser, hvordan hans artsfæller bliver behandlet af menneskene, og det bryder han sig absolut ikke om. Han bryder nu ud af sit bur – og starter et oprør. Nu bliver det en kamp for overlevelse – aber mod mennesker!
Primatologen Davis Okoye har taget sig af den intelligente gorilla George, siden den var en unge. Da et videnskabeligt eksperiment går galt, forvandles George og andre dyr til dødsensfarlige super skabninger. Nu må Davis finde en kur og forhindre en global katastrofe.
Fabel bliver virkelighed, når Jason vender tilbage til sin fars hjemland på Filippinerne efter hans bortgang og undersøger de historier, han voksede op med at høre. Jason vil ære sin fars hjem. Når han ankommer, finder han sig selv efter at leve de myter, som hans far fortalte ham som barn. Den mystiske Magayon, kendt som Woman in the Woods, beder Jason om at hjælpe hende på sin søgen efter at vende tilbage til sit hjem på en vulkansk ø på Filippinerne. Dette er starten på et mytisk eventyr, der vil ændre Jasons liv.