西暦2015年。人類を襲う謎の兵器「使徒」に対抗するため、汎用人型決戦兵器エヴァンゲリオンを完成させた特務機関ネルフは、14歳の少年少女達をパイロットにエヴァを実戦投入する。しかしその後ろでは同時に「人類補完計画」が進行していた。

高級レストランの二人の客。フォークの汚れをボーイに注意すると、支配人が来て手厚くお詫びをされる。すると料理長が出てきて事態はますます大げさになり…。男たちが並んで訓練を受けている。指揮官は「スイカにしよう」と決心する。すると男たちは「スイカはもうやりました」とうんざりしたように答える。そこで彼は「バナナだ」と言いバナナに襲われた時の対処法を実演する...。

フジヨキ台の平凡な高校生・麻中蓬は、ある日の帰り道、「怪獣使い」を名乗る怪しい男・ガウマと出会う。そんな彼らの前に出現する巨大怪獣、そして巨大ロボット〈ダイナゼノン〉！

高校１年生の響裕太は、ある日、目覚めると記憶喪失になっていた。そして裕太は古いパソコンの画面に映るハイパーエージェント“グリッドマン”と出会う。