L'Scooby-Doo, en Shaggy, la Velma, la Daphne i en Fred es reuneixen per resoldre el més graciós i aterridor misteri de la seva carrera. L'equip de la por viatja a una misteriosa illa per investigar el fantasma del pirata Moonscar. Però resulta que l'esperit de l'espadatxí no és l'únic personatge esfereïdor de l'illa... És la primera de les pel·lícules llançades directament a vídeo/DVD basades en el personatge d'Scooby-Doo.