1666年の過去を見て、サラ・フィアーにまつわる真実を知ったディーナ。そして時は1994年、シェイディサイドの未来のために、仲間たちが命がけの戦いに挑む。

不思議な力を持つ高校生たちが共に魔女として活動することに。だが、魔術が思いもよらない事態を引き起こしてしまい...。カルト的な人気を誇る「ザ・クラフト」の続編。

看護士の裕子（加護亜依）は芙季絵という少女の担当になってから、自分の身辺で奇妙な現象が起きるようなったと感じていた。検査をすると芙季絵の体内から嚢腫が発見されるが、それはこの世に生を受けることのできなかった者たちのうらみが集結したものだった。やがて芙季絵の父親は殺人を犯し発狂したため、母は娘の除霊を頼むが……。