Ethan Hunt és un superespia capaç de dur a terme la missió més perillosa amb la màxima eficàcia i elegància. Forma part d'un competent equip dirigit per l'agent Jim Phelps, que ha tornat a reunir als seus homes per participar en una dificilíssima missió: evitar la venda d'un disc robat que conté informació secreta de vital importància.
Després d'haver dut a terme diverses missions, l'agent especial Ethan Hunt s'ha retirat del servei actiu i s'ha promès amb la seva estimada Julia. Però, quan és segrestat un dels agents entrenats per ell, tornarà de nou a l'acció. També haurà d'enfrontar-se a Owen Davian, un individu sense escrúpols que trafica amb armes i amb informació.
L'Ethan Hunt aquesta vegada, dirigeix el seu equip de l'FMI en una missió per a capturar un virus alemany mortal abans que els terroristes l'utilitzin. La seva missió es fa impossible ja que ell no és l'única persona que va al darrere d'aquest virus. Haurà de competir amb una panda de terroristes internacionals encapçalats per un malvat ex agent de l'FMI que ja ha aconseguit fer-se amb l'antídot del virus.
L'argument gira al voltant d'en Bob Esponja i els seus inseparables amics del mar, com ho són en Patrick Estrella i la Sorreta l'esquirol, i altres personatges de la sèrie en què es basa, com en Balamar i el senyor Krank. En aquesta ocasió en Bob Esponja i la colla s'embarquen en una aventura en què hauran de trobar una recepta robada, cosa que portarà els personatges de Baixos de Bikini fins a la nostra dimensió. La pel·lícula barreja animació i escenes d'acció real.
John Brown és un innocent guàrdia de seguretat que somia ser el millor agent de policia del món. Quan accidentalment el seu camí es creui amb el malvat Sanford Scolex serà donat per mort. A l'hospital, Brenda Bradford us implantarà al cos 14.000 dispositius fàcils d'utilitzar. Quan Brown desperti, s'haurà transformat a l'Inspector Gadget, una màquina perfectament preparada per lluitar contra el crim. Basada en la sèrie de dibuixos animats de TV dels anys vuitanta. Efectes especials de Stan Winston.