両親を亡くし孤児となった10歳の少年ルイスは、魔法使いの伯父ジョナサンが住む古い屋敷に引っ越す。ほどなくしてルイスは、ジョナサンより優れた力を持った魔女である隣人のツィマーマンとも知り合いになり、彼らは同じ屋根の下で暮らすことになる。しかしある日、ルイスは屋敷の中に世界を破滅に導く邪悪な力を持つ時計が隠されていることを知り、二人と力を合わせて時計を見つけ出すべく奮闘する
カンザスのサーカス一座のしがない奇術師オズ。ある日彼は竜巻に巻き込まれ、不思議な魔法の国にたどり着く。そこでは邪悪な魔女の圧政に苦しむ領民たちが、いつか偉大な魔法使いのオズが現われると救世主の登場を待ち望んでいて、名前の偶然の一致から、到着したオズのことをすっかり当の救世主と思い込んでしまう。オズは美しい魔女の姉妹、エヴァノラとセオドラに言われるがまま、悪い魔女のグリンダを倒す旅に出かける。