Den unge fårefarmer, Johnny, er følelsesmæssigt ude af balance. Hans far er delvist lammet efter et hjerteanfald og sammen med sin bedstemor, er de ene om at drive farmen. Da læmmeperioden nærmer sig, er de nødt til at hyre hjælp udefra og ansætter den unge rumæner Gheorge. Gheorges ankomst er starten på et intenst forhold mellem de to unge mænd, og det får Johnny til at betragte sig selv i et ganske anderledes lys.

En mand, C (Casey Affleck), bliver kørt ned og dræbt. Hans kæreste, M (Rooney Mara), er naturligvis knust, men da hun tager hjem fra lighuset efter at have identificeret ham, sker der noget mærkeligt. Han rejser sig op, stadig iført sit ligklæde, og følger efter hende! A Ghost Story er en usædvanlig spøgelseshistorie. Langsom, mediterende, tryllebindende. Der udspiller sig et hjerteskærende, men næsten ikke-eksisterende drama mellem de to karakterer: Kvinden, der kun kan sørge, og spøgelset, der ikke kan trøste hende.