En genert teenagedrengs manglende evne til at sige nej bliver sat på prøve, da en viljestærk pige hiver ham med på en mystisk rejse for at finde sin forsvundne mor.
En amerikansk ubåd, USS Alabama, lastet med atommissiler, har under en global krise kurs mod Rusland. Ombord er kaptajn Ramsey og hans næstkommanderende, Hunter. Ubåden modtager en halv ordre og mister derefter radiokontakten. Skal der affyres atommissiler, eller skal der ikke? De to officerer med deres respektive, meget forskelligartede livssyn, har hver deres udlægning af ordren. Krigen, som måske ikke/måske er brudt ud over havets overflade, blir' i ubåden til to mænds kamp om magten over atomerne.
De eventyr eksploderer i aktion med debut af Mewtwo, en bio-manipuleret Pokemon skabt ud fra DNA Mew, den sjældneste af alle Pokemon. Fast besluttet på at bevise sin overlegenhed, Mewtwo lokker Ash, Pikachu og andre til en Pokémon kamp som ingen før. Mewtwo vs Mew. Super-kloner vs Pokemon. Det er den ultimative opgør ... med den meget verdens fremtid på spil!
Året er 1866, stedet er England og dampmaskinen er godt i gang med at revolutionere samfundet. Drengen Eddie er opfinder som sin far og farfar, der begge er rejst væk for at arbejde på et hemmeligt projekt. En dag får Eddie en mystisk pakke fra sin farfar, og snart er drengen dybt involveret i et gigantisk kapløb om morgendagens teknologi.
Helten blev tilbage i Atlantis med sin nye kærlighed, Prinsesse Kida, mens resten af ekspeditionen vendte tilbage til Jordens overflade. Imidlertid visser det sig ikke at holde bare at "glemme" Atlantis. Et forfærdeligt havuhyre dukker op og synes at være forbundet med Atlantis, så venner må have fat i Milo og Kida igen. Snart sker der også mystiske ting ude i ørkenen, og til sidst forsvinder et spyd fra Whitmores samling. Alt sammen pager hen mod en truende katastrofe, som denne gang ikke blot vil ramme Atlantis, men hele Jorden.