En gådefuld, sortklædt revolvermand, El Topo, ridder gennem ørkenen med sin søn. Deres mål er ikke indlysende, og deres skæbne er ikke fastlagt. De gør holdt på deres valfart, da de kommer til en lille by udplyndret af banditter, der har slagtet dens beboere. El Topo beslutter sig for at hævne dem, og endnu mere blod vil flyde. Men det er blot den første i en række brutale hændelser på deres færd.

Fem år efter den amerikanske borgerkrig halser en anskudt mand gennem Nevadas isnende bjerge og strømfald. Lige i hælene på ham følger den lige så sammenbidte oberst Carver, der stædigt jagter sit bytte helt ind i den bagende ørken. Men hvorfor er Carver så besat af at få fingrene i denne Gideon?