Batman torna per continuar la seva guerra contra el crim. Amb l'ajuda del tinent Jim Gordon i del fiscal del districte Harvey Dent, Batman es proposa destruir el crim organitzat de Gotham City. Sembla que tot va bé fins que apareix un nou criminal, el Joker, que desencadenarà el caos i el terror a la ciutat.
És el món el que sembla? Thomas Anderson, programador d'una important empresa de software i hacker informàtic amb el sobrenom de Neo, descobrirà que no. Contactarà amb ell un estrany grup encapçalat per Morfeu, qui el mostrarà la veritable realitat que s'amaga darrere l'aparença: un món dominat per les màquines, les quals esclavitzen la humanitat per a utilitzar els nostres cossos com a simple font d'energia. Però, i la nostra ment, on es troba aleshores? La resposta es troba dins Matrix.
En Peter Parker és un adolescent tímid, miop, bon estudiant, sense sort amb les noies... Però tot això canvia quan, en un laboratori, una aranya mutada genèticament el pica. Des d'aleshores descobrirà que pot llançar teranyines des dels canells, fer salts impossibles o pujar el gratacels més alt enfilant-se per la paret. Ja com a Spider-Man, els seus poders li serviran per lluitar contra el Follet Verd, un científic que després d'experimentar amb si mateix es torna superpoderós i malvat.
Han passat dos anys des que en Peter Parker aconseguís dominar els seus nous poders. Encara no s'ha acostumat a la seva doble vida de fotògraf i superheroi, ha de fer front a tota mena de problemes personals i, a més a més, la Mary Jane continua fora del seu abast. Però haurà de deixar de banda les crisis existencials per enfrontar-se a un problema molt més gros: el Dr. Octopus.
Krank, un científic prematurament envellit per la seva incapacitat per somiar, decideix contrarestar-ho segrestant nens en una ciutat portuària i arrossegar-los fins a la plataforma marina on viu. El seu objectiu és apoderar-se dels seus somnis, però el terror dels nens és tant gran, que només els hi roba els seus malsons. Una nena de nou anys, Miga, s’alia amb un gegant, One, per tal de rescatar al seu germà de les mans del científic.
Una organització governamental secreta s'encarrega de protegir la Terra de les amenaces alienígenes.
John Constantine és un detectiu que, literalment, ha estat a l'infern i n'ha tornat. John va néixer amb un do que no desitjava: reconèixer entre la gent els àngels i els dimonis que viuen a la Terra sota un aspecte humà. Aquestes visions el turmentaven i va decidir suïcidar-se, però va ressuscitar en contra de la seva voluntat. Ara, havent vist l'infern, John ha de guanyar-se la salvació enviant els esbirros de Satanàs cap a les profunditats i també haurà d'ajudar una altra policia, Angela Dodson, a resoldre el misteriós suïcidi de la seva germana bessona.
Johnny, Carmen, Dizzy i Ace són quatre joves amics que finalitzen l'institut i fan plans per al futur. Hi domina l'espai com el lloc més desitjable per aprendre un ofici i treballar. La Terra es troba en guerra amb una raça d'insectes alienígenes gegants, i els quatre amics estudiaran disciplines per destruir-los. Però cadascú anirà a una unitat diferent, segons les capacitats. Johnny es veu separat de la seva xicota, Carmen, ja que ell ha d'anar a infanteria. El dia que Johnny decideix marxar de l'exèrcit, els insectes arrasen la ciutat natal. És la guerra.
Thomas "Neo" Anderson va prendre una costosa decisió quan va decidir fer la pregunta que Morfeu i Trinity havien formulat abans que ell. Cercar i acceptar la veritat. Alliberar la seva ment de Matrix. Ara, Neo adquireix un major domini dels seus extraordinaris poders mentre Sió cau assetjada per l'Exèrcit de les Màquines. Només una qüestió d'hores separa a l'últim enclavament humà a la Terra de 250.000 Sentinelles programats per destruir a la humanitat. Però els ciutadans de Sió, animats per la convicció de Morfeu que l'Elegit farà realitat la Profecia de l'Oracle i posarà fi a la guerra amb les Màquines, posen totes les seves esperances i expectatives en Neo, que es troba bloquejat per visions inquietants mentre cerca quines mesures prendre.
Queden vint hores per a la irrupció de les màquines a Sió, el darrer bastió dels humans lliures. Mentre el cos de Neo roman en coma, la seva consciència es troba a terra de ningú, en un lloc entre el món humà i el de les màquines.
En Peter Parker finalment aconsegueix l'equilibri entre la seva devoció per la Mary Jane i els seus deures com a superheroi. De sobte el seu vestit es torna negre i millora els seus poders, però també treu el costat més fosc i venjatiu de la seva personalitat. Obligat a triar entre el poder temptador que li dona el nou vestit i l'heroi compassiu que era abans, en Peter haurà de vèncer els seus propis dimonis mentre s'enfronta a en Venom i l'Home de Sorra.
Han passat quatre anys des que els agents J i K, els Homes de Negre buscadors d'alienígenes, van evitar un desastre intergalàctic, i des d'aleshores, K ha tornat a la comoditat de la seva vida civil, mentre que J continua la seva feina controlant els extraterrestres. Ara, davant una greu amenaça, J haurà de convèncer K perquè torni als Homes de Negre i l'ajudi a salvar la Terra.