Ketika Inspektur Lee dari Hong Kong dipanggil ke Los Angeles untuk menyelidiki penculikan, FBI tidak menginginkan bantuan dari luar dan menugaskan Detektif LAPD James Carter yang sombong untuk mengalihkan perhatian Lee dari kasus tersebut. Tidak puas menyaksikan aksi tersebut dari pinggir lapangan, Lee dan Carter membentuk kemitraan yang tidak terduga dan menyelidiki sendiri kasus tersebut.

Di Jepang yang dilanda perang, Shogun Tokugawa, yang putus asa untuk memulihkan perdamaian bagi rakyatnya, memerintahkan pembunuhan para panglima perang yang bermusuhan. Seorang wanita muda yang cantik dibesarkan sejak lahir dengan sembilan anak yatim lainnya, untuk menjadi seorang pembunuh. Namanya Azumi, pembunuh utama.

Ini adalah waktu liburan bagi Carter saat ia mendapati dirinya bersama Lee di Hong Kong dan mengharapkan lebih banyak kegembiraan. Saat Carter ingin berpesta dan bertemu para wanita, Lee keluar untuk melacak pemimpin geng Triad yang mungkin bertanggung jawab atas pembunuhan dua pria di Kedutaan Besar Amerika. Segalanya menjadi rumit ketika pasangan tersebut tersandung pada plot palsu. Anak-anak lelaki itu segera terlibat perkelahian dan situasi yang mengancam jiwa. Perjalanan kembali ke AS mungkin memberikan jawaban tentang pemboman, pemalsuan, dan kesetiaan sebenarnya dari agen bea cukai seksi Isabella.

Setelah berhasil menyelamatkan nyawa pewaris penting di klan Arashikage, Snake Eyes si petarung tunggal akhirnya diundang ke Jepang oleh klan tersebut. Klan Arashikage dikenal dengan para ninjanya yang telah membawa perdamaian dunia selama 600 tahun lamanya. Maka dari itu, Snake Eyes ditunjuk dan mulai dilatih untuk menjadi bagian dari klan Arashikage dengan kemampuan berpedangnya. Lambat laun, rahasia besar Snake Eyes pada masa lalu pun terungkap, yang tentunya akan berdampak pada kepercayaan dari orang-orang terdekatnya.

Setelah upaya pembunuhan yang gagal, duo yang tidak cocok ini menemukan diri mereka di Paris, berjuang untuk mendapatkan kembali daftar nama yang berharga, ketika kaki tangan sindikat kejahatan pembunuhan mencoba yang terbaik untuk menghentikan mereka. Sekali lagi, Lee dan Carter harus berjuang melewati gangster berbahaya; Namun, kali ini, masa lalu kembali menghantui Lee. Akankah anak-anak ini menyelesaikan pekerjaannya untuk selamanya?