ディズニーを代表するキャラクターであるミッキーマウスを主人公にした短編アニメーション。1928年に製作された「ミッキーマウス」シリーズの第1作『蒸気船ウィリー』を思わせるクラシックなモノクロ映像と、最先端技術を駆使した映像が融合する中、ミッキーマウスのユーモラスでスリリングな活躍が映し出されていく。『カーズ』シリーズなどのジョン・ラセターが製作総指揮を担当、彼の指示によってアーカイブに保存されているウォルト・ディズニー本人の音声を抽出してミッキーマウスの声が創造されている。なお本作は、『アナと雪の女王』の同時上映作品となっている。

ロサンゼルス。魔女のイザベル・ビグローが、魔法を使わないで恋を見つけるために人間の世界に舞い降りてきた。一人暮らしを始めたイザベルだが思い通りに事が進まない彼女の前に一人の男性が現われた。いまは落ち目の元トップスター俳優、ジャック・ワイヤットだ。テレビドラマ『奥さまは魔女』のダーリン役で復活を図りたい彼は、自分を目立たさせる奥さま役を探していた。彼女は出演することに決めるが、撮影現場での自分勝手なジャックの態度に怒りを募らせる。

6500万年前、巨大隕石の落下によって、恐竜世界と人間世界が2つに引き裂かれた。絶滅したと思われていた恐竜は進化し、独自の世界を地下に作り上げていった。 そして現代のニューヨーク・ブルックリン。ある1人の女性が教会の前で何かを置きその場を去って行く。それは1つの大きな卵と小さな石。教会のシスター達はこれらを拾う。シスター達の前で何と卵から人間の赤ん坊が生まれた。更に20年の時が経った。ブルックリンで配管工の仕事を請け負うマリオとルイージの兄弟は、地下の下水路で化石発掘を行う調査チームのリーダーであるデイジーと知り合う。ある日、マリオとルイージはデイジー、マリオの恋人ダニエラと外食を楽しむ。食事後マリオ達と別れたダニエラが突然2人の謎の男に誘拐され、その次にデイジーも誘拐されてしまった。マリオ達は後を追い地下を訪れた。そこではデイジーが謎の入り口に引きずり込まれ、マリオ達もその入り口に飛び込んだ。その先には広大な地下空間に広がる恐竜人の帝国を発見した。デイジーを探してさ迷う2人に、地下帝国の王クッパの手が迫る。